Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28,08■■■□□ 2,09
KhsrpQ3U0V1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
KhsrpQ3U0V1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,07■■■□□ 2,08
KhsrpQ3U0V1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,06■■■□□ 2,08
KhsrpQ3U0V1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28,06■■■□□ 2,08
KhsrpQ3U0V1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
KhsrpQ3U0V1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
KhsrpQ3U0V1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
KhsrpQ3U0V1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
KhsrpQ3U0V1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28,05■■■□□ 2,08
KhsrpQ3U0V1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
KhsrpQ3U0V1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,04■■■□□ 2,08
KhsrpQ3U0V1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
KhsrpQ3U0V1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28,02■■■□□ 2,08
KhsrpQ3U0V1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
KhsrpQ3U0V1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
KhsrpQ3U0V1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
KhsrpQ3U0V1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
KhsrpQ3U0V1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
KhsrpQ3U0V1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
KhsrpQ3U0V1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
KhsrpQ3U0V1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
KhsrpQ3U0V1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
KhsrpQ3U0V1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
KhsrpQ3U0V1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
KhsrpQ3U0V1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27,94■■■□□ 2,06
KhsrpQ3U0V1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27,94■■■□□ 2,06
KhsrpQ3U0V1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
KhsrpQ3U0V1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27,92■■■□□ 2,06
KhsrpQ3U0V1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
KhsrpQ3U0V1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27,91■■■□□ 2,06
KhsrpQ3U0V1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
KhsrpQ3U0V1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
KhsrpQ3U0V1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
KhsrpQ3U0V1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
KhsrpQ3U0V1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
KhsrpQ3U0V1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
KhsrpQ3U0V1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
KhsrpQ3U0V1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
KhsrpQ3U0V1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
KhsrpQ3U0V1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
KhsrpQ3U0V1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
KhsrpQ3U0V1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
KhsrpQ3U0V1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27,82■■■□□ 2,04
KhsrpQ3U0V1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
KhsrpQ3U0V1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27,81■■■□□ 2,04
KhsrpQ3U0V1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
KhsrpQ3U0V1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
KhsrpQ3U0V1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,79■■■□□ 2,04
KhsrpQ3U0V1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
KhsrpQ3U0V1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
KhsrpQ3U0V1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
KhsrpQ3U0V1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
KhsrpQ3U0V1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,74■■■□□ 2,03
KhsrpQ3U0V1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
KhsrpQ3U0V1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27,73■■■□□ 2,03
KhsrpQ3U0V1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27,72■■■□□ 2,03
KhsrpQ3U0V1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
KhsrpQ3U0V1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
KhsrpQ3U0V1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
KhsrpQ3U0V1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27,69■■■□□ 2,02
KhsrpQ3U0V1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27,69■■■□□ 2,02
KhsrpQ3U0V1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
KhsrpQ3U0V1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
KhsrpQ3U0V1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,67■■■□□ 2,02
KhsrpQ3U0V1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
KhsrpQ3U0V1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
KhsrpQ3U0V1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27,66■■■□□ 2,02
KhsrpQ3U0V1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
KhsrpQ3U0V1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
KhsrpQ3U0V1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,65■■■□□ 2,02
KhsrpQ3U0V1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
KhsrpQ3U0V1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
KhsrpQ3U0V1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27,63■■■□□ 2,01
KhsrpQ3U0V1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27,62■■■□□ 2,01
KhsrpQ3U0V1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
KhsrpQ3U0V1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
KhsrpQ3U0V1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
KhsrpQ3U0V1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
KhsrpQ3U0V1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27,58■■■□□ 2,01
KhsrpQ3U0V1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
KhsrpQ3U0V1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
KhsrpQ3U0V1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,56■■■□□ 2
KhsrpQ3U0V1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,56■■■□□ 2
KhsrpQ3U0V1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
KhsrpQ3U0V1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
KhsrpQ3U0V1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
KhsrpQ3U0V1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27,53■■■□□ 2
KhsrpQ3U0V1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
KhsrpQ3U0V1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■■□□ 2
KhsrpQ3U0V1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27,51■■□□□ 1,99
KhsrpQ3U0V1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,51■■□□□ 1,99
KhsrpQ3U0V1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
KhsrpQ3U0V1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,5■■□□□ 1,99
KhsrpQ3U0V1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
KhsrpQ3U0V1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
KhsrpQ3U0V1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
KhsrpQ3U0V1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,49■■□□□ 1,99
KhsrpQ3U0V1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,49■■□□□ 1,99
KhsrpQ3U0V1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms