Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLD5

Uri1, Unconventional prefoldin RPB5 interactor, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uri1Q3TLD5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Uri1Q3TLD5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Uri1Q3TLD5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Uri1Q3TLD5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Uri1Q3TLD5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Uri1Q3TLD5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Uri1Q3TLD5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Uri1Q3TLD5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Uri1Q3TLD5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Uri1Q3TLD5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Uri1Q3TLD5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Uri1Q3TLD5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Uri1Q3TLD5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Uri1Q3TLD5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Uri1Q3TLD5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Uri1Q3TLD5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Uri1Q3TLD5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Uri1Q3TLD5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Uri1Q3TLD5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Uri1Q3TLD5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Uri1Q3TLD5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Uri1Q3TLD5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Uri1Q3TLD5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Uri1Q3TLD5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Uri1Q3TLD5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Uri1Q3TLD5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Uri1Q3TLD5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Uri1Q3TLD5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Uri1Q3TLD5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Uri1Q3TLD5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Uri1Q3TLD5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Uri1Q3TLD5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Uri1Q3TLD5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Uri1Q3TLD5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Uri1Q3TLD5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Uri1Q3TLD5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Uri1Q3TLD5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Uri1Q3TLD5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Uri1Q3TLD5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Uri1Q3TLD5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Uri1Q3TLD5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Uri1Q3TLD5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Uri1Q3TLD5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Uri1Q3TLD5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Uri1Q3TLD5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Uri1Q3TLD5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Uri1Q3TLD5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Uri1Q3TLD5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Uri1Q3TLD5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Uri1Q3TLD5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Uri1Q3TLD5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Uri1Q3TLD5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Uri1Q3TLD5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Uri1Q3TLD5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uri1Q3TLD5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Uri1Q3TLD5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Uri1Q3TLD5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Uri1Q3TLD5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Uri1Q3TLD5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Uri1Q3TLD5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Uri1Q3TLD5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Uri1Q3TLD5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Uri1Q3TLD5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Uri1Q3TLD5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Uri1Q3TLD5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Uri1Q3TLD5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Uri1Q3TLD5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Uri1Q3TLD5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Uri1Q3TLD5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Uri1Q3TLD5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Uri1Q3TLD5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Uri1Q3TLD5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Uri1Q3TLD5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Uri1Q3TLD5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Uri1Q3TLD5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Uri1Q3TLD5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Uri1Q3TLD5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Uri1Q3TLD5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Uri1Q3TLD5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Uri1Q3TLD5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Uri1Q3TLD5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Uri1Q3TLD5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Uri1Q3TLD5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Uri1Q3TLD5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Uri1Q3TLD5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Uri1Q3TLD5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Uri1Q3TLD5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Uri1Q3TLD5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Uri1Q3TLD5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Uri1Q3TLD5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Uri1Q3TLD5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Uri1Q3TLD5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Uri1Q3TLD5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Uri1Q3TLD5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Uri1Q3TLD5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Uri1Q3TLD5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Uri1Q3TLD5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Uri1Q3TLD5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Uri1Q3TLD5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Uri1Q3TLD5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms