Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nlrx1Q3TL44 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nlrx1Q3TL44 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nlrx1Q3TL44 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nlrx1Q3TL44 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Nlrx1Q3TL44 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nlrx1Q3TL44 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nlrx1Q3TL44 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nlrx1Q3TL44 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nlrx1Q3TL44 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nlrx1Q3TL44 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nlrx1Q3TL44 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Nlrx1Q3TL44 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Nlrx1Q3TL44 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nlrx1Q3TL44 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nlrx1Q3TL44 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nlrx1Q3TL44 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nlrx1Q3TL44 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nlrx1Q3TL44 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nlrx1Q3TL44 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nlrx1Q3TL44 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nlrx1Q3TL44 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nlrx1Q3TL44 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nlrx1Q3TL44 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Nlrx1Q3TL44 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nlrx1Q3TL44 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nlrx1Q3TL44 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nlrx1Q3TL44 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nlrx1Q3TL44 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nlrx1Q3TL44 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nlrx1Q3TL44 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nlrx1Q3TL44 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nlrx1Q3TL44 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nlrx1Q3TL44 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nlrx1Q3TL44 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nlrx1Q3TL44 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Nlrx1Q3TL44 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nlrx1Q3TL44 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nlrx1Q3TL44 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nlrx1Q3TL44 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Nlrx1Q3TL44 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nlrx1Q3TL44 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nlrx1Q3TL44 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nlrx1Q3TL44 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nlrx1Q3TL44 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nlrx1Q3TL44 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nlrx1Q3TL44 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nlrx1Q3TL44 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nlrx1Q3TL44 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nlrx1Q3TL44 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nlrx1Q3TL44 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nlrx1Q3TL44 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nlrx1Q3TL44 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nlrx1Q3TL44 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nlrx1Q3TL44 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nlrx1Q3TL44 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Nlrx1Q3TL44 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nlrx1Q3TL44 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nlrx1Q3TL44 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nlrx1Q3TL44 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nlrx1Q3TL44 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nlrx1Q3TL44 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nlrx1Q3TL44 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nlrx1Q3TL44 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Nlrx1Q3TL44 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nlrx1Q3TL44 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nlrx1Q3TL44 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nlrx1Q3TL44 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nlrx1Q3TL44 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nlrx1Q3TL44 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nlrx1Q3TL44 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nlrx1Q3TL44 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nlrx1Q3TL44 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nlrx1Q3TL44 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nlrx1Q3TL44 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nlrx1Q3TL44 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nlrx1Q3TL44 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nlrx1Q3TL44 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nlrx1Q3TL44 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nlrx1Q3TL44 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nlrx1Q3TL44 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nlrx1Q3TL44 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nlrx1Q3TL44 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nlrx1Q3TL44 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nlrx1Q3TL44 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nlrx1Q3TL44 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nlrx1Q3TL44 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Nlrx1Q3TL44 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nlrx1Q3TL44 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nlrx1Q3TL44 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nlrx1Q3TL44 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nlrx1Q3TL44 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nlrx1Q3TL44 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nlrx1Q3TL44 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nlrx1Q3TL44 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nlrx1Q3TL44 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Nlrx1Q3TL44 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nlrx1Q3TL44 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nlrx1Q3TL44 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nlrx1Q3TL44 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms