Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
Smarca4Q3TKT4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC45.28■■■■■ 4.84
Smarca4Q3TKT4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.28■■■■■ 4.84
Smarca4Q3TKT4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
Smarca4Q3TKT4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC45.27■■■■■ 4.84
Smarca4Q3TKT4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.24■■■■■ 4.83
Smarca4Q3TKT4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
Smarca4Q3TKT4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC45.22■■■■■ 4.83
Smarca4Q3TKT4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC45.22■■■■■ 4.83
Smarca4Q3TKT4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
Smarca4Q3TKT4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
Smarca4Q3TKT4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC45.2■■■■■ 4.83
Smarca4Q3TKT4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
Smarca4Q3TKT4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC45.19■■■■■ 4.83
Smarca4Q3TKT4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC45.19■■■■■ 4.82
Smarca4Q3TKT4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
Smarca4Q3TKT4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
Smarca4Q3TKT4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
Smarca4Q3TKT4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
Smarca4Q3TKT4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
Smarca4Q3TKT4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
Smarca4Q3TKT4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
Smarca4Q3TKT4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
Smarca4Q3TKT4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC45.11■■■■■ 4.81
Smarca4Q3TKT4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
Smarca4Q3TKT4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
Smarca4Q3TKT4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
Smarca4Q3TKT4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
Smarca4Q3TKT4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
Smarca4Q3TKT4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
Smarca4Q3TKT4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
Smarca4Q3TKT4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
Smarca4Q3TKT4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
Smarca4Q3TKT4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
Smarca4Q3TKT4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
Smarca4Q3TKT4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC44.96■■■■■ 4.79
Smarca4Q3TKT4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
Smarca4Q3TKT4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
Smarca4Q3TKT4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
Smarca4Q3TKT4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
Smarca4Q3TKT4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
Smarca4Q3TKT4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
Smarca4Q3TKT4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
Smarca4Q3TKT4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
Smarca4Q3TKT4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC44.91■■■■■ 4.78
Smarca4Q3TKT4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
Smarca4Q3TKT4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
Smarca4Q3TKT4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
Smarca4Q3TKT4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.89■■■■■ 4.78
Smarca4Q3TKT4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC44.89■■■■■ 4.78
Smarca4Q3TKT4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
Smarca4Q3TKT4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.88■■■■■ 4.78
Smarca4Q3TKT4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC44.87■■■■■ 4.77
Smarca4Q3TKT4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
Smarca4Q3TKT4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC44.84■■■■■ 4.77
Smarca4Q3TKT4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
Smarca4Q3TKT4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.78■■■■■ 4.76
Smarca4Q3TKT4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
Smarca4Q3TKT4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC44.76■■■■■ 4.76
Smarca4Q3TKT4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
Smarca4Q3TKT4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC44.75■■■■■ 4.75
Smarca4Q3TKT4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC44.74■■■■■ 4.75
Smarca4Q3TKT4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
Smarca4Q3TKT4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC44.72■■■■■ 4.75
Smarca4Q3TKT4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC44.72■■■■■ 4.75
Smarca4Q3TKT4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
Smarca4Q3TKT4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC44.7■■■■■ 4.75
Smarca4Q3TKT4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
Smarca4Q3TKT4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.75
Smarca4Q3TKT4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.69■■■■■ 4.74
Smarca4Q3TKT4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
Smarca4Q3TKT4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
Smarca4Q3TKT4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC44.68■■■■■ 4.74
Smarca4Q3TKT4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC44.67■■■■■ 4.74
Smarca4Q3TKT4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
Smarca4Q3TKT4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
Smarca4Q3TKT4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC44.63■■■■■ 4.73
Smarca4Q3TKT4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
Smarca4Q3TKT4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
Smarca4Q3TKT4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
Smarca4Q3TKT4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
Smarca4Q3TKT4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
Smarca4Q3TKT4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC44.56■■■■■ 4.72
Smarca4Q3TKT4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC44.53■■■■■ 4.72
Smarca4Q3TKT4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
Smarca4Q3TKT4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC44.5■■■■■ 4.71
Smarca4Q3TKT4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC44.5■■■■■ 4.71
Smarca4Q3TKT4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC44.49■■■■■ 4.71
Smarca4Q3TKT4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.48■■■■■ 4.71
Smarca4Q3TKT4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC44.47■■■■■ 4.71
Smarca4Q3TKT4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
Smarca4Q3TKT4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
Smarca4Q3TKT4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
Smarca4Q3TKT4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
Smarca4Q3TKT4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
Smarca4Q3TKT4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
Smarca4Q3TKT4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.7
Smarca4Q3TKT4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.7
Smarca4Q3TKT4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
Smarca4Q3TKT4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms