Protein–RNA interactions for Protein: Q3TFD2

Lpcat1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat1Q3TFD2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lpcat1Q3TFD2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lpcat1Q3TFD2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lpcat1Q3TFD2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lpcat1Q3TFD2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lpcat1Q3TFD2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lpcat1Q3TFD2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lpcat1Q3TFD2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lpcat1Q3TFD2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lpcat1Q3TFD2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lpcat1Q3TFD2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lpcat1Q3TFD2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lpcat1Q3TFD2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lpcat1Q3TFD2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lpcat1Q3TFD2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lpcat1Q3TFD2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lpcat1Q3TFD2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lpcat1Q3TFD2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lpcat1Q3TFD2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lpcat1Q3TFD2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lpcat1Q3TFD2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lpcat1Q3TFD2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lpcat1Q3TFD2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lpcat1Q3TFD2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lpcat1Q3TFD2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lpcat1Q3TFD2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lpcat1Q3TFD2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lpcat1Q3TFD2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lpcat1Q3TFD2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lpcat1Q3TFD2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lpcat1Q3TFD2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lpcat1Q3TFD2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lpcat1Q3TFD2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lpcat1Q3TFD2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lpcat1Q3TFD2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lpcat1Q3TFD2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lpcat1Q3TFD2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lpcat1Q3TFD2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lpcat1Q3TFD2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lpcat1Q3TFD2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lpcat1Q3TFD2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lpcat1Q3TFD2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lpcat1Q3TFD2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lpcat1Q3TFD2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Lpcat1Q3TFD2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lpcat1Q3TFD2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Lpcat1Q3TFD2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lpcat1Q3TFD2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lpcat1Q3TFD2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lpcat1Q3TFD2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lpcat1Q3TFD2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lpcat1Q3TFD2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lpcat1Q3TFD2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lpcat1Q3TFD2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lpcat1Q3TFD2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lpcat1Q3TFD2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lpcat1Q3TFD2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lpcat1Q3TFD2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lpcat1Q3TFD2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lpcat1Q3TFD2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lpcat1Q3TFD2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lpcat1Q3TFD2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lpcat1Q3TFD2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lpcat1Q3TFD2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lpcat1Q3TFD2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lpcat1Q3TFD2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lpcat1Q3TFD2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lpcat1Q3TFD2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lpcat1Q3TFD2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lpcat1Q3TFD2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lpcat1Q3TFD2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lpcat1Q3TFD2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lpcat1Q3TFD2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lpcat1Q3TFD2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lpcat1Q3TFD2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lpcat1Q3TFD2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lpcat1Q3TFD2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lpcat1Q3TFD2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lpcat1Q3TFD2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lpcat1Q3TFD2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lpcat1Q3TFD2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lpcat1Q3TFD2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lpcat1Q3TFD2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lpcat1Q3TFD2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lpcat1Q3TFD2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lpcat1Q3TFD2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lpcat1Q3TFD2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lpcat1Q3TFD2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lpcat1Q3TFD2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lpcat1Q3TFD2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lpcat1Q3TFD2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lpcat1Q3TFD2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lpcat1Q3TFD2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lpcat1Q3TFD2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lpcat1Q3TFD2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lpcat1Q3TFD2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lpcat1Q3TFD2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lpcat1Q3TFD2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lpcat1Q3TFD2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lpcat1Q3TFD2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms