Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc69Q3TCJ8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc69Q3TCJ8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc69Q3TCJ8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc69Q3TCJ8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc69Q3TCJ8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc69Q3TCJ8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc69Q3TCJ8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc69Q3TCJ8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc69Q3TCJ8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc69Q3TCJ8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc69Q3TCJ8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc69Q3TCJ8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc69Q3TCJ8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc69Q3TCJ8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc69Q3TCJ8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc69Q3TCJ8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc69Q3TCJ8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc69Q3TCJ8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc69Q3TCJ8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc69Q3TCJ8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc69Q3TCJ8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc69Q3TCJ8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc69Q3TCJ8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc69Q3TCJ8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc69Q3TCJ8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc69Q3TCJ8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc69Q3TCJ8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc69Q3TCJ8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc69Q3TCJ8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc69Q3TCJ8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc69Q3TCJ8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc69Q3TCJ8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc69Q3TCJ8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc69Q3TCJ8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc69Q3TCJ8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc69Q3TCJ8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc69Q3TCJ8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc69Q3TCJ8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc69Q3TCJ8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc69Q3TCJ8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc69Q3TCJ8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc69Q3TCJ8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc69Q3TCJ8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc69Q3TCJ8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc69Q3TCJ8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc69Q3TCJ8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc69Q3TCJ8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc69Q3TCJ8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc69Q3TCJ8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc69Q3TCJ8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc69Q3TCJ8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc69Q3TCJ8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc69Q3TCJ8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc69Q3TCJ8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc69Q3TCJ8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc69Q3TCJ8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc69Q3TCJ8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc69Q3TCJ8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc69Q3TCJ8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc69Q3TCJ8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc69Q3TCJ8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc69Q3TCJ8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc69Q3TCJ8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc69Q3TCJ8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc69Q3TCJ8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc69Q3TCJ8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc69Q3TCJ8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc69Q3TCJ8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc69Q3TCJ8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc69Q3TCJ8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc69Q3TCJ8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc69Q3TCJ8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc69Q3TCJ8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc69Q3TCJ8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc69Q3TCJ8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc69Q3TCJ8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc69Q3TCJ8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc69Q3TCJ8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc69Q3TCJ8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc69Q3TCJ8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc69Q3TCJ8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc69Q3TCJ8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc69Q3TCJ8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc69Q3TCJ8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc69Q3TCJ8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc69Q3TCJ8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc69Q3TCJ8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc69Q3TCJ8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms