Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cul4aQ3TCH7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cul4aQ3TCH7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cul4aQ3TCH7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cul4aQ3TCH7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cul4aQ3TCH7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cul4aQ3TCH7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cul4aQ3TCH7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cul4aQ3TCH7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cul4aQ3TCH7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cul4aQ3TCH7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cul4aQ3TCH7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cul4aQ3TCH7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Cul4aQ3TCH7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cul4aQ3TCH7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cul4aQ3TCH7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cul4aQ3TCH7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cul4aQ3TCH7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cul4aQ3TCH7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cul4aQ3TCH7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cul4aQ3TCH7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cul4aQ3TCH7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cul4aQ3TCH7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cul4aQ3TCH7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cul4aQ3TCH7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cul4aQ3TCH7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cul4aQ3TCH7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cul4aQ3TCH7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cul4aQ3TCH7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cul4aQ3TCH7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cul4aQ3TCH7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cul4aQ3TCH7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cul4aQ3TCH7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cul4aQ3TCH7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cul4aQ3TCH7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cul4aQ3TCH7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cul4aQ3TCH7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cul4aQ3TCH7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cul4aQ3TCH7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cul4aQ3TCH7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cul4aQ3TCH7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cul4aQ3TCH7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cul4aQ3TCH7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cul4aQ3TCH7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cul4aQ3TCH7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cul4aQ3TCH7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cul4aQ3TCH7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cul4aQ3TCH7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cul4aQ3TCH7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cul4aQ3TCH7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cul4aQ3TCH7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cul4aQ3TCH7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cul4aQ3TCH7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cul4aQ3TCH7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cul4aQ3TCH7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cul4aQ3TCH7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cul4aQ3TCH7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Cul4aQ3TCH7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cul4aQ3TCH7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cul4aQ3TCH7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cul4aQ3TCH7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cul4aQ3TCH7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cul4aQ3TCH7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cul4aQ3TCH7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cul4aQ3TCH7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cul4aQ3TCH7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cul4aQ3TCH7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cul4aQ3TCH7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cul4aQ3TCH7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cul4aQ3TCH7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cul4aQ3TCH7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cul4aQ3TCH7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cul4aQ3TCH7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cul4aQ3TCH7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cul4aQ3TCH7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cul4aQ3TCH7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cul4aQ3TCH7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cul4aQ3TCH7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cul4aQ3TCH7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cul4aQ3TCH7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cul4aQ3TCH7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cul4aQ3TCH7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cul4aQ3TCH7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cul4aQ3TCH7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cul4aQ3TCH7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cul4aQ3TCH7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cul4aQ3TCH7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cul4aQ3TCH7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cul4aQ3TCH7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cul4aQ3TCH7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cul4aQ3TCH7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cul4aQ3TCH7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cul4aQ3TCH7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cul4aQ3TCH7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cul4aQ3TCH7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cul4aQ3TCH7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cul4aQ3TCH7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cul4aQ3TCH7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cul4aQ3TCH7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cul4aQ3TCH7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
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