Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc127Q3TC33 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc127Q3TC33 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc127Q3TC33 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc127Q3TC33 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc127Q3TC33 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc127Q3TC33 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc127Q3TC33 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc127Q3TC33 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc127Q3TC33 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc127Q3TC33 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc127Q3TC33 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc127Q3TC33 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc127Q3TC33 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc127Q3TC33 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc127Q3TC33 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc127Q3TC33 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc127Q3TC33 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc127Q3TC33 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc127Q3TC33 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc127Q3TC33 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc127Q3TC33 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc127Q3TC33 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc127Q3TC33 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc127Q3TC33 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc127Q3TC33 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc127Q3TC33 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc127Q3TC33 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc127Q3TC33 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc127Q3TC33 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc127Q3TC33 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc127Q3TC33 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc127Q3TC33 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc127Q3TC33 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc127Q3TC33 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc127Q3TC33 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc127Q3TC33 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc127Q3TC33 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc127Q3TC33 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc127Q3TC33 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc127Q3TC33 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc127Q3TC33 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc127Q3TC33 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc127Q3TC33 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc127Q3TC33 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc127Q3TC33 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc127Q3TC33 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc127Q3TC33 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc127Q3TC33 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc127Q3TC33 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc127Q3TC33 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc127Q3TC33 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc127Q3TC33 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc127Q3TC33 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc127Q3TC33 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc127Q3TC33 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc127Q3TC33 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc127Q3TC33 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc127Q3TC33 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc127Q3TC33 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc127Q3TC33 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc127Q3TC33 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc127Q3TC33 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc127Q3TC33 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc127Q3TC33 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc127Q3TC33 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc127Q3TC33 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc127Q3TC33 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc127Q3TC33 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc127Q3TC33 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc127Q3TC33 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc127Q3TC33 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc127Q3TC33 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc127Q3TC33 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc127Q3TC33 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc127Q3TC33 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc127Q3TC33 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc127Q3TC33 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc127Q3TC33 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc127Q3TC33 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc127Q3TC33 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc127Q3TC33 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc127Q3TC33 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc127Q3TC33 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc127Q3TC33 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc127Q3TC33 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc127Q3TC33 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc127Q3TC33 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc127Q3TC33 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc127Q3TC33 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc127Q3TC33 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc127Q3TC33 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc127Q3TC33 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc127Q3TC33 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc127Q3TC33 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc127Q3TC33 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc127Q3TC33 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc127Q3TC33 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc127Q3TC33 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc127Q3TC33 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms