Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccbe1Q3MI99 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccbe1Q3MI99 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccbe1Q3MI99 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccbe1Q3MI99 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccbe1Q3MI99 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccbe1Q3MI99 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccbe1Q3MI99 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccbe1Q3MI99 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccbe1Q3MI99 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccbe1Q3MI99 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccbe1Q3MI99 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccbe1Q3MI99 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccbe1Q3MI99 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccbe1Q3MI99 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccbe1Q3MI99 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccbe1Q3MI99 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccbe1Q3MI99 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccbe1Q3MI99 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccbe1Q3MI99 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccbe1Q3MI99 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccbe1Q3MI99 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccbe1Q3MI99 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccbe1Q3MI99 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccbe1Q3MI99 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccbe1Q3MI99 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccbe1Q3MI99 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccbe1Q3MI99 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccbe1Q3MI99 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccbe1Q3MI99 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccbe1Q3MI99 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccbe1Q3MI99 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccbe1Q3MI99 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccbe1Q3MI99 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccbe1Q3MI99 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccbe1Q3MI99 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccbe1Q3MI99 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccbe1Q3MI99 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccbe1Q3MI99 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccbe1Q3MI99 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccbe1Q3MI99 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccbe1Q3MI99 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccbe1Q3MI99 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccbe1Q3MI99 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccbe1Q3MI99 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccbe1Q3MI99 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccbe1Q3MI99 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccbe1Q3MI99 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccbe1Q3MI99 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccbe1Q3MI99 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccbe1Q3MI99 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccbe1Q3MI99 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccbe1Q3MI99 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccbe1Q3MI99 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccbe1Q3MI99 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccbe1Q3MI99 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccbe1Q3MI99 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccbe1Q3MI99 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccbe1Q3MI99 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccbe1Q3MI99 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccbe1Q3MI99 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccbe1Q3MI99 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccbe1Q3MI99 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccbe1Q3MI99 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccbe1Q3MI99 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccbe1Q3MI99 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccbe1Q3MI99 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccbe1Q3MI99 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccbe1Q3MI99 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccbe1Q3MI99 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccbe1Q3MI99 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccbe1Q3MI99 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccbe1Q3MI99 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccbe1Q3MI99 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccbe1Q3MI99 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccbe1Q3MI99 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccbe1Q3MI99 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccbe1Q3MI99 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccbe1Q3MI99 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccbe1Q3MI99 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccbe1Q3MI99 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccbe1Q3MI99 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccbe1Q3MI99 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccbe1Q3MI99 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccbe1Q3MI99 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccbe1Q3MI99 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccbe1Q3MI99 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccbe1Q3MI99 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccbe1Q3MI99 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccbe1Q3MI99 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccbe1Q3MI99 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccbe1Q3MI99 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccbe1Q3MI99 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccbe1Q3MI99 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccbe1Q3MI99 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccbe1Q3MI99 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccbe1Q3MI99 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccbe1Q3MI99 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms