Protein–RNA interactions for Protein: Q32NY4

Cnnm3, Metal transporter CNNM3, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm3Q32NY4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cnnm3Q32NY4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cnnm3Q32NY4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cnnm3Q32NY4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cnnm3Q32NY4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Cnnm3Q32NY4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cnnm3Q32NY4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cnnm3Q32NY4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cnnm3Q32NY4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cnnm3Q32NY4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cnnm3Q32NY4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cnnm3Q32NY4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cnnm3Q32NY4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cnnm3Q32NY4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cnnm3Q32NY4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Cnnm3Q32NY4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cnnm3Q32NY4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cnnm3Q32NY4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cnnm3Q32NY4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cnnm3Q32NY4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cnnm3Q32NY4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cnnm3Q32NY4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cnnm3Q32NY4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cnnm3Q32NY4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cnnm3Q32NY4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cnnm3Q32NY4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cnnm3Q32NY4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Cnnm3Q32NY4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cnnm3Q32NY4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cnnm3Q32NY4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cnnm3Q32NY4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cnnm3Q32NY4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cnnm3Q32NY4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cnnm3Q32NY4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cnnm3Q32NY4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cnnm3Q32NY4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cnnm3Q32NY4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cnnm3Q32NY4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cnnm3Q32NY4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cnnm3Q32NY4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cnnm3Q32NY4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cnnm3Q32NY4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cnnm3Q32NY4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cnnm3Q32NY4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cnnm3Q32NY4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cnnm3Q32NY4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cnnm3Q32NY4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cnnm3Q32NY4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cnnm3Q32NY4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cnnm3Q32NY4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cnnm3Q32NY4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cnnm3Q32NY4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cnnm3Q32NY4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cnnm3Q32NY4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cnnm3Q32NY4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cnnm3Q32NY4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cnnm3Q32NY4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cnnm3Q32NY4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cnnm3Q32NY4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cnnm3Q32NY4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cnnm3Q32NY4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cnnm3Q32NY4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cnnm3Q32NY4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cnnm3Q32NY4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cnnm3Q32NY4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cnnm3Q32NY4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cnnm3Q32NY4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Cnnm3Q32NY4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cnnm3Q32NY4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cnnm3Q32NY4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cnnm3Q32NY4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cnnm3Q32NY4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cnnm3Q32NY4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cnnm3Q32NY4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cnnm3Q32NY4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cnnm3Q32NY4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cnnm3Q32NY4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cnnm3Q32NY4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cnnm3Q32NY4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cnnm3Q32NY4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cnnm3Q32NY4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cnnm3Q32NY4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cnnm3Q32NY4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cnnm3Q32NY4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cnnm3Q32NY4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cnnm3Q32NY4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cnnm3Q32NY4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Cnnm3Q32NY4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cnnm3Q32NY4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cnnm3Q32NY4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cnnm3Q32NY4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cnnm3Q32NY4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cnnm3Q32NY4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cnnm3Q32NY4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cnnm3Q32NY4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cnnm3Q32NY4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Cnnm3Q32NY4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cnnm3Q32NY4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cnnm3Q32NY4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cnnm3Q32NY4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms