Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rtl9Q32KG4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rtl9Q32KG4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rtl9Q32KG4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Rtl9Q32KG4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rtl9Q32KG4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rtl9Q32KG4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Rtl9Q32KG4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rtl9Q32KG4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rtl9Q32KG4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rtl9Q32KG4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rtl9Q32KG4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rtl9Q32KG4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rtl9Q32KG4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rtl9Q32KG4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtl9Q32KG4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtl9Q32KG4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtl9Q32KG4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rtl9Q32KG4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtl9Q32KG4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtl9Q32KG4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtl9Q32KG4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtl9Q32KG4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtl9Q32KG4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtl9Q32KG4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rtl9Q32KG4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rtl9Q32KG4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rtl9Q32KG4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtl9Q32KG4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rtl9Q32KG4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rtl9Q32KG4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rtl9Q32KG4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtl9Q32KG4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtl9Q32KG4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtl9Q32KG4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rtl9Q32KG4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rtl9Q32KG4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rtl9Q32KG4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rtl9Q32KG4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rtl9Q32KG4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rtl9Q32KG4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rtl9Q32KG4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rtl9Q32KG4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rtl9Q32KG4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rtl9Q32KG4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rtl9Q32KG4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rtl9Q32KG4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rtl9Q32KG4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtl9Q32KG4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtl9Q32KG4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtl9Q32KG4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtl9Q32KG4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtl9Q32KG4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtl9Q32KG4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Rtl9Q32KG4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rtl9Q32KG4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rtl9Q32KG4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rtl9Q32KG4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rtl9Q32KG4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rtl9Q32KG4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rtl9Q32KG4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rtl9Q32KG4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rtl9Q32KG4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rtl9Q32KG4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rtl9Q32KG4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rtl9Q32KG4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rtl9Q32KG4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rtl9Q32KG4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Rtl9Q32KG4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rtl9Q32KG4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rtl9Q32KG4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rtl9Q32KG4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Rtl9Q32KG4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rtl9Q32KG4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rtl9Q32KG4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rtl9Q32KG4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rtl9Q32KG4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rtl9Q32KG4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rtl9Q32KG4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rtl9Q32KG4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rtl9Q32KG4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Rtl9Q32KG4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rtl9Q32KG4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rtl9Q32KG4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rtl9Q32KG4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rtl9Q32KG4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rtl9Q32KG4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rtl9Q32KG4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rtl9Q32KG4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rtl9Q32KG4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rtl9Q32KG4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Rtl9Q32KG4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rtl9Q32KG4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rtl9Q32KG4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rtl9Q32KG4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rtl9Q32KG4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rtl9Q32KG4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rtl9Q32KG4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rtl9Q32KG4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rtl9Q32KG4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms