Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hdgfl1Q2VPR5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hdgfl1Q2VPR5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hdgfl1Q2VPR5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hdgfl1Q2VPR5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hdgfl1Q2VPR5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hdgfl1Q2VPR5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hdgfl1Q2VPR5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hdgfl1Q2VPR5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hdgfl1Q2VPR5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hdgfl1Q2VPR5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Hdgfl1Q2VPR5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hdgfl1Q2VPR5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hdgfl1Q2VPR5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hdgfl1Q2VPR5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hdgfl1Q2VPR5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hdgfl1Q2VPR5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hdgfl1Q2VPR5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hdgfl1Q2VPR5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hdgfl1Q2VPR5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Hdgfl1Q2VPR5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hdgfl1Q2VPR5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hdgfl1Q2VPR5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hdgfl1Q2VPR5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hdgfl1Q2VPR5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hdgfl1Q2VPR5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hdgfl1Q2VPR5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hdgfl1Q2VPR5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hdgfl1Q2VPR5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hdgfl1Q2VPR5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hdgfl1Q2VPR5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hdgfl1Q2VPR5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hdgfl1Q2VPR5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hdgfl1Q2VPR5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Hdgfl1Q2VPR5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hdgfl1Q2VPR5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hdgfl1Q2VPR5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hdgfl1Q2VPR5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hdgfl1Q2VPR5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hdgfl1Q2VPR5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hdgfl1Q2VPR5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hdgfl1Q2VPR5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hdgfl1Q2VPR5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Hdgfl1Q2VPR5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hdgfl1Q2VPR5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hdgfl1Q2VPR5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hdgfl1Q2VPR5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hdgfl1Q2VPR5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hdgfl1Q2VPR5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hdgfl1Q2VPR5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hdgfl1Q2VPR5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hdgfl1Q2VPR5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hdgfl1Q2VPR5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hdgfl1Q2VPR5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdgfl1Q2VPR5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdgfl1Q2VPR5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hdgfl1Q2VPR5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hdgfl1Q2VPR5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hdgfl1Q2VPR5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hdgfl1Q2VPR5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hdgfl1Q2VPR5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hdgfl1Q2VPR5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hdgfl1Q2VPR5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hdgfl1Q2VPR5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hdgfl1Q2VPR5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hdgfl1Q2VPR5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hdgfl1Q2VPR5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hdgfl1Q2VPR5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hdgfl1Q2VPR5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hdgfl1Q2VPR5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hdgfl1Q2VPR5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hdgfl1Q2VPR5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hdgfl1Q2VPR5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdgfl1Q2VPR5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hdgfl1Q2VPR5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hdgfl1Q2VPR5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hdgfl1Q2VPR5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hdgfl1Q2VPR5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Hdgfl1Q2VPR5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hdgfl1Q2VPR5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hdgfl1Q2VPR5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hdgfl1Q2VPR5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hdgfl1Q2VPR5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hdgfl1Q2VPR5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdgfl1Q2VPR5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdgfl1Q2VPR5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdgfl1Q2VPR5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdgfl1Q2VPR5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hdgfl1Q2VPR5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hdgfl1Q2VPR5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hdgfl1Q2VPR5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hdgfl1Q2VPR5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hdgfl1Q2VPR5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hdgfl1Q2VPR5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hdgfl1Q2VPR5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms