Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vax1Q2NKI2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vax1Q2NKI2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vax1Q2NKI2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vax1Q2NKI2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vax1Q2NKI2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vax1Q2NKI2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vax1Q2NKI2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vax1Q2NKI2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vax1Q2NKI2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vax1Q2NKI2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Vax1Q2NKI2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Vax1Q2NKI2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vax1Q2NKI2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vax1Q2NKI2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vax1Q2NKI2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vax1Q2NKI2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vax1Q2NKI2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vax1Q2NKI2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vax1Q2NKI2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vax1Q2NKI2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vax1Q2NKI2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vax1Q2NKI2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vax1Q2NKI2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vax1Q2NKI2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vax1Q2NKI2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vax1Q2NKI2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vax1Q2NKI2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vax1Q2NKI2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vax1Q2NKI2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vax1Q2NKI2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vax1Q2NKI2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vax1Q2NKI2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vax1Q2NKI2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vax1Q2NKI2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vax1Q2NKI2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vax1Q2NKI2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vax1Q2NKI2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vax1Q2NKI2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vax1Q2NKI2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vax1Q2NKI2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vax1Q2NKI2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vax1Q2NKI2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vax1Q2NKI2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vax1Q2NKI2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vax1Q2NKI2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vax1Q2NKI2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vax1Q2NKI2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vax1Q2NKI2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vax1Q2NKI2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vax1Q2NKI2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vax1Q2NKI2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vax1Q2NKI2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Vax1Q2NKI2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vax1Q2NKI2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vax1Q2NKI2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vax1Q2NKI2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vax1Q2NKI2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vax1Q2NKI2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vax1Q2NKI2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vax1Q2NKI2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vax1Q2NKI2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vax1Q2NKI2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vax1Q2NKI2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vax1Q2NKI2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vax1Q2NKI2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vax1Q2NKI2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vax1Q2NKI2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vax1Q2NKI2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vax1Q2NKI2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vax1Q2NKI2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Vax1Q2NKI2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vax1Q2NKI2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vax1Q2NKI2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vax1Q2NKI2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vax1Q2NKI2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vax1Q2NKI2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vax1Q2NKI2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vax1Q2NKI2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vax1Q2NKI2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vax1Q2NKI2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vax1Q2NKI2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vax1Q2NKI2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vax1Q2NKI2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vax1Q2NKI2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vax1Q2NKI2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vax1Q2NKI2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vax1Q2NKI2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vax1Q2NKI2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vax1Q2NKI2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vax1Q2NKI2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vax1Q2NKI2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vax1Q2NKI2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vax1Q2NKI2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vax1Q2NKI2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vax1Q2NKI2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vax1Q2NKI2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vax1Q2NKI2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vax1Q2NKI2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vax1Q2NKI2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms