Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpne9Q1RLL3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpne9Q1RLL3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpne9Q1RLL3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpne9Q1RLL3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cpne9Q1RLL3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cpne9Q1RLL3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpne9Q1RLL3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpne9Q1RLL3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpne9Q1RLL3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cpne9Q1RLL3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cpne9Q1RLL3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cpne9Q1RLL3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cpne9Q1RLL3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cpne9Q1RLL3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cpne9Q1RLL3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cpne9Q1RLL3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cpne9Q1RLL3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cpne9Q1RLL3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpne9Q1RLL3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpne9Q1RLL3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpne9Q1RLL3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpne9Q1RLL3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpne9Q1RLL3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpne9Q1RLL3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cpne9Q1RLL3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Cpne9Q1RLL3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cpne9Q1RLL3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cpne9Q1RLL3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cpne9Q1RLL3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cpne9Q1RLL3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cpne9Q1RLL3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cpne9Q1RLL3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cpne9Q1RLL3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cpne9Q1RLL3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cpne9Q1RLL3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cpne9Q1RLL3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpne9Q1RLL3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpne9Q1RLL3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpne9Q1RLL3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpne9Q1RLL3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpne9Q1RLL3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpne9Q1RLL3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpne9Q1RLL3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpne9Q1RLL3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpne9Q1RLL3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpne9Q1RLL3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpne9Q1RLL3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpne9Q1RLL3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cpne9Q1RLL3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cpne9Q1RLL3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cpne9Q1RLL3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpne9Q1RLL3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpne9Q1RLL3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpne9Q1RLL3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpne9Q1RLL3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cpne9Q1RLL3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cpne9Q1RLL3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpne9Q1RLL3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpne9Q1RLL3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpne9Q1RLL3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpne9Q1RLL3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpne9Q1RLL3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpne9Q1RLL3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpne9Q1RLL3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cpne9Q1RLL3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpne9Q1RLL3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpne9Q1RLL3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpne9Q1RLL3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpne9Q1RLL3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpne9Q1RLL3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpne9Q1RLL3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpne9Q1RLL3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpne9Q1RLL3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpne9Q1RLL3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpne9Q1RLL3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpne9Q1RLL3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpne9Q1RLL3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpne9Q1RLL3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpne9Q1RLL3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpne9Q1RLL3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpne9Q1RLL3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpne9Q1RLL3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpne9Q1RLL3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpne9Q1RLL3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpne9Q1RLL3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpne9Q1RLL3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpne9Q1RLL3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpne9Q1RLL3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpne9Q1RLL3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpne9Q1RLL3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpne9Q1RLL3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpne9Q1RLL3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpne9Q1RLL3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpne9Q1RLL3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpne9Q1RLL3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpne9Q1RLL3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpne9Q1RLL3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpne9Q1RLL3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
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