Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ptchd1Q14B62 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ptchd1Q14B62 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ptchd1Q14B62 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ptchd1Q14B62 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ptchd1Q14B62 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ptchd1Q14B62 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ptchd1Q14B62 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ptchd1Q14B62 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ptchd1Q14B62 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ptchd1Q14B62 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ptchd1Q14B62 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ptchd1Q14B62 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ptchd1Q14B62 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ptchd1Q14B62 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ptchd1Q14B62 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ptchd1Q14B62 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ptchd1Q14B62 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ptchd1Q14B62 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ptchd1Q14B62 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ptchd1Q14B62 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ptchd1Q14B62 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ptchd1Q14B62 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ptchd1Q14B62 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ptchd1Q14B62 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ptchd1Q14B62 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ptchd1Q14B62 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ptchd1Q14B62 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ptchd1Q14B62 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ptchd1Q14B62 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ptchd1Q14B62 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ptchd1Q14B62 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ptchd1Q14B62 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ptchd1Q14B62 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ptchd1Q14B62 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ptchd1Q14B62 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ptchd1Q14B62 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ptchd1Q14B62 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ptchd1Q14B62 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ptchd1Q14B62 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ptchd1Q14B62 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ptchd1Q14B62 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ptchd1Q14B62 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ptchd1Q14B62 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ptchd1Q14B62 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ptchd1Q14B62 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ptchd1Q14B62 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ptchd1Q14B62 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ptchd1Q14B62 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ptchd1Q14B62 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ptchd1Q14B62 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ptchd1Q14B62 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ptchd1Q14B62 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ptchd1Q14B62 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ptchd1Q14B62 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ptchd1Q14B62 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ptchd1Q14B62 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ptchd1Q14B62 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ptchd1Q14B62 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ptchd1Q14B62 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ptchd1Q14B62 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ptchd1Q14B62 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ptchd1Q14B62 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ptchd1Q14B62 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ptchd1Q14B62 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ptchd1Q14B62 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ptchd1Q14B62 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ptchd1Q14B62 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ptchd1Q14B62 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ptchd1Q14B62 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ptchd1Q14B62 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ptchd1Q14B62 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ptchd1Q14B62 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ptchd1Q14B62 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ptchd1Q14B62 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ptchd1Q14B62 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ptchd1Q14B62 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ptchd1Q14B62 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ptchd1Q14B62 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ptchd1Q14B62 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ptchd1Q14B62 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ptchd1Q14B62 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ptchd1Q14B62 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ptchd1Q14B62 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ptchd1Q14B62 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ptchd1Q14B62 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ptchd1Q14B62 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ptchd1Q14B62 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ptchd1Q14B62 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ptchd1Q14B62 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ptchd1Q14B62 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ptchd1Q14B62 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ptchd1Q14B62 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ptchd1Q14B62 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ptchd1Q14B62 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ptchd1Q14B62 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ptchd1Q14B62 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ptchd1Q14B62 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ptchd1Q14B62 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ptchd1Q14B62 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
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