Protein–RNA interactions for Protein: Q08EG8

Krtap10-4, Keratin-associated protein 10-4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap10-4Q08EG8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krtap10-4Q08EG8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krtap10-4Q08EG8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krtap10-4Q08EG8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krtap10-4Q08EG8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krtap10-4Q08EG8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krtap10-4Q08EG8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krtap10-4Q08EG8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krtap10-4Q08EG8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krtap10-4Q08EG8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krtap10-4Q08EG8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krtap10-4Q08EG8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krtap10-4Q08EG8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krtap10-4Q08EG8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krtap10-4Q08EG8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krtap10-4Q08EG8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krtap10-4Q08EG8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krtap10-4Q08EG8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krtap10-4Q08EG8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krtap10-4Q08EG8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krtap10-4Q08EG8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krtap10-4Q08EG8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krtap10-4Q08EG8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krtap10-4Q08EG8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krtap10-4Q08EG8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krtap10-4Q08EG8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krtap10-4Q08EG8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krtap10-4Q08EG8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krtap10-4Q08EG8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krtap10-4Q08EG8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krtap10-4Q08EG8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krtap10-4Q08EG8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krtap10-4Q08EG8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krtap10-4Q08EG8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Krtap10-4Q08EG8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krtap10-4Q08EG8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krtap10-4Q08EG8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krtap10-4Q08EG8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krtap10-4Q08EG8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krtap10-4Q08EG8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krtap10-4Q08EG8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krtap10-4Q08EG8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krtap10-4Q08EG8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krtap10-4Q08EG8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krtap10-4Q08EG8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krtap10-4Q08EG8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krtap10-4Q08EG8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krtap10-4Q08EG8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krtap10-4Q08EG8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krtap10-4Q08EG8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krtap10-4Q08EG8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krtap10-4Q08EG8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krtap10-4Q08EG8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krtap10-4Q08EG8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krtap10-4Q08EG8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krtap10-4Q08EG8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krtap10-4Q08EG8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krtap10-4Q08EG8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krtap10-4Q08EG8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krtap10-4Q08EG8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krtap10-4Q08EG8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krtap10-4Q08EG8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krtap10-4Q08EG8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krtap10-4Q08EG8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krtap10-4Q08EG8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap10-4Q08EG8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap10-4Q08EG8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap10-4Q08EG8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap10-4Q08EG8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krtap10-4Q08EG8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krtap10-4Q08EG8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krtap10-4Q08EG8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krtap10-4Q08EG8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krtap10-4Q08EG8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krtap10-4Q08EG8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krtap10-4Q08EG8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krtap10-4Q08EG8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krtap10-4Q08EG8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krtap10-4Q08EG8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krtap10-4Q08EG8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krtap10-4Q08EG8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krtap10-4Q08EG8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krtap10-4Q08EG8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krtap10-4Q08EG8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krtap10-4Q08EG8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap10-4Q08EG8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap10-4Q08EG8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap10-4Q08EG8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap10-4Q08EG8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap10-4Q08EG8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krtap10-4Q08EG8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krtap10-4Q08EG8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krtap10-4Q08EG8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krtap10-4Q08EG8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krtap10-4Q08EG8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krtap10-4Q08EG8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krtap10-4Q08EG8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krtap10-4Q08EG8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krtap10-4Q08EG8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krtap10-4Q08EG8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms