Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tff1Q08423 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tff1Q08423 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tff1Q08423 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tff1Q08423 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tff1Q08423 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tff1Q08423 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tff1Q08423 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tff1Q08423 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tff1Q08423 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tff1Q08423 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tff1Q08423 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tff1Q08423 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tff1Q08423 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tff1Q08423 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tff1Q08423 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tff1Q08423 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tff1Q08423 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tff1Q08423 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tff1Q08423 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tff1Q08423 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tff1Q08423 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tff1Q08423 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tff1Q08423 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tff1Q08423 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tff1Q08423 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tff1Q08423 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tff1Q08423 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tff1Q08423 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tff1Q08423 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tff1Q08423 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tff1Q08423 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tff1Q08423 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tff1Q08423 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tff1Q08423 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tff1Q08423 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tff1Q08423 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tff1Q08423 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tff1Q08423 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tff1Q08423 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tff1Q08423 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tff1Q08423 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tff1Q08423 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tff1Q08423 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tff1Q08423 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tff1Q08423 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tff1Q08423 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tff1Q08423 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tff1Q08423 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tff1Q08423 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tff1Q08423 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tff1Q08423 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tff1Q08423 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tff1Q08423 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tff1Q08423 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tff1Q08423 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tff1Q08423 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tff1Q08423 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tff1Q08423 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tff1Q08423 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tff1Q08423 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tff1Q08423 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tff1Q08423 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tff1Q08423 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tff1Q08423 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tff1Q08423 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tff1Q08423 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tff1Q08423 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tff1Q08423 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tff1Q08423 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tff1Q08423 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tff1Q08423 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tff1Q08423 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tff1Q08423 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tff1Q08423 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tff1Q08423 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tff1Q08423 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tff1Q08423 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tff1Q08423 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tff1Q08423 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tff1Q08423 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tff1Q08423 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tff1Q08423 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tff1Q08423 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tff1Q08423 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tff1Q08423 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tff1Q08423 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tff1Q08423 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tff1Q08423 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tff1Q08423 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tff1Q08423 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tff1Q08423 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tff1Q08423 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tff1Q08423 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tff1Q08423 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tff1Q08423 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tff1Q08423 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tff1Q08423 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tff1Q08423 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tff1Q08423 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms