Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnn2Q08093 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnn2Q08093 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnn2Q08093 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnn2Q08093 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnn2Q08093 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnn2Q08093 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnn2Q08093 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnn2Q08093 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnn2Q08093 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnn2Q08093 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnn2Q08093 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnn2Q08093 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnn2Q08093 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnn2Q08093 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnn2Q08093 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnn2Q08093 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnn2Q08093 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnn2Q08093 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnn2Q08093 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnn2Q08093 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnn2Q08093 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnn2Q08093 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnn2Q08093 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnn2Q08093 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnn2Q08093 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnn2Q08093 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnn2Q08093 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnn2Q08093 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnn2Q08093 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnn2Q08093 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnn2Q08093 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnn2Q08093 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnn2Q08093 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnn2Q08093 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnn2Q08093 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnn2Q08093 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnn2Q08093 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnn2Q08093 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnn2Q08093 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnn2Q08093 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnn2Q08093 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnn2Q08093 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnn2Q08093 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnn2Q08093 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnn2Q08093 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnn2Q08093 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnn2Q08093 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnn2Q08093 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnn2Q08093 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnn2Q08093 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnn2Q08093 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnn2Q08093 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnn2Q08093 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnn2Q08093 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnn2Q08093 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnn2Q08093 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnn2Q08093 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnn2Q08093 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnn2Q08093 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnn2Q08093 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnn2Q08093 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnn2Q08093 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnn2Q08093 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnn2Q08093 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnn2Q08093 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnn2Q08093 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnn2Q08093 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnn2Q08093 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnn2Q08093 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnn2Q08093 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnn2Q08093 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnn2Q08093 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnn2Q08093 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnn2Q08093 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnn2Q08093 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnn2Q08093 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnn2Q08093 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnn2Q08093 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnn2Q08093 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnn2Q08093 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnn2Q08093 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnn2Q08093 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnn2Q08093 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnn2Q08093 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnn2Q08093 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnn2Q08093 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnn2Q08093 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnn2Q08093 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnn2Q08093 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnn2Q08093 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnn2Q08093 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnn2Q08093 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cnn2Q08093 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnn2Q08093 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnn2Q08093 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnn2Q08093 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnn2Q08093 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnn2Q08093 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnn2Q08093 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms