Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
F13bQ07968 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
F13bQ07968 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
F13bQ07968 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
F13bQ07968 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
F13bQ07968 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
F13bQ07968 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
F13bQ07968 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
F13bQ07968 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
F13bQ07968 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
F13bQ07968 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
F13bQ07968 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
F13bQ07968 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
F13bQ07968 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
F13bQ07968 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
F13bQ07968 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
F13bQ07968 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
F13bQ07968 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
F13bQ07968 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
F13bQ07968 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
F13bQ07968 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
F13bQ07968 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
F13bQ07968 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
F13bQ07968 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
F13bQ07968 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
F13bQ07968 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
F13bQ07968 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
F13bQ07968 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
F13bQ07968 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
F13bQ07968 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
F13bQ07968 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
F13bQ07968 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
F13bQ07968 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
F13bQ07968 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
F13bQ07968 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
F13bQ07968 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
F13bQ07968 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
F13bQ07968 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
F13bQ07968 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
F13bQ07968 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
F13bQ07968 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
F13bQ07968 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
F13bQ07968 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
F13bQ07968 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
F13bQ07968 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
F13bQ07968 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
F13bQ07968 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
F13bQ07968 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
F13bQ07968 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
F13bQ07968 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
F13bQ07968 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
F13bQ07968 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
F13bQ07968 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
F13bQ07968 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
F13bQ07968 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
F13bQ07968 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
F13bQ07968 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
F13bQ07968 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
F13bQ07968 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
F13bQ07968 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
F13bQ07968 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
F13bQ07968 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
F13bQ07968 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
F13bQ07968 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
F13bQ07968 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
F13bQ07968 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
F13bQ07968 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
F13bQ07968 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
F13bQ07968 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
F13bQ07968 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
F13bQ07968 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
F13bQ07968 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
F13bQ07968 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
F13bQ07968 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
F13bQ07968 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
F13bQ07968 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
F13bQ07968 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
F13bQ07968 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
F13bQ07968 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
F13bQ07968 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
F13bQ07968 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
F13bQ07968 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
F13bQ07968 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
F13bQ07968 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
F13bQ07968 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
F13bQ07968 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
F13bQ07968 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
F13bQ07968 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
F13bQ07968 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
F13bQ07968 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
F13bQ07968 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
F13bQ07968 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
F13bQ07968 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
F13bQ07968 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
F13bQ07968 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
F13bQ07968 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
F13bQ07968 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
F13bQ07968 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
F13bQ07968 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
F13bQ07968 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms