Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col9a2Q07643 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col9a2Q07643 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col9a2Q07643 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col9a2Q07643 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col9a2Q07643 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col9a2Q07643 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col9a2Q07643 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col9a2Q07643 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col9a2Q07643 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Col9a2Q07643 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col9a2Q07643 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col9a2Q07643 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col9a2Q07643 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Col9a2Q07643 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Col9a2Q07643 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Col9a2Q07643 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Col9a2Q07643 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Col9a2Q07643 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Col9a2Q07643 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Col9a2Q07643 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Col9a2Q07643 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Col9a2Q07643 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Col9a2Q07643 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col9a2Q07643 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Col9a2Q07643 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col9a2Q07643 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col9a2Q07643 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col9a2Q07643 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col9a2Q07643 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Col9a2Q07643 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Col9a2Q07643 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Col9a2Q07643 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Col9a2Q07643 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Col9a2Q07643 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Col9a2Q07643 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col9a2Q07643 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col9a2Q07643 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col9a2Q07643 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col9a2Q07643 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col9a2Q07643 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col9a2Q07643 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col9a2Q07643 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col9a2Q07643 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col9a2Q07643 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Col9a2Q07643 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col9a2Q07643 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col9a2Q07643 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col9a2Q07643 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col9a2Q07643 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col9a2Q07643 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Col9a2Q07643 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col9a2Q07643 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col9a2Q07643 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col9a2Q07643 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Col9a2Q07643 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col9a2Q07643 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col9a2Q07643 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col9a2Q07643 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col9a2Q07643 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col9a2Q07643 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col9a2Q07643 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col9a2Q07643 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col9a2Q07643 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Col9a2Q07643 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col9a2Q07643 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col9a2Q07643 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Col9a2Q07643 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col9a2Q07643 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Col9a2Q07643 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Col9a2Q07643 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col9a2Q07643 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col9a2Q07643 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Col9a2Q07643 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Col9a2Q07643 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Col9a2Q07643 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Col9a2Q07643 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Col9a2Q07643 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col9a2Q07643 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col9a2Q07643 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col9a2Q07643 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col9a2Q07643 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Col9a2Q07643 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col9a2Q07643 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col9a2Q07643 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col9a2Q07643 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col9a2Q07643 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col9a2Q07643 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col9a2Q07643 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col9a2Q07643 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col9a2Q07643 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col9a2Q07643 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col9a2Q07643 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col9a2Q07643 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col9a2Q07643 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col9a2Q07643 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col9a2Q07643 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col9a2Q07643 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col9a2Q07643 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col9a2Q07643 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms