Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sox9Q04887 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sox9Q04887 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sox9Q04887 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sox9Q04887 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sox9Q04887 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sox9Q04887 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sox9Q04887 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sox9Q04887 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sox9Q04887 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sox9Q04887 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sox9Q04887 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sox9Q04887 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sox9Q04887 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sox9Q04887 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sox9Q04887 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sox9Q04887 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sox9Q04887 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sox9Q04887 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sox9Q04887 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sox9Q04887 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sox9Q04887 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sox9Q04887 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sox9Q04887 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sox9Q04887 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sox9Q04887 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sox9Q04887 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sox9Q04887 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sox9Q04887 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sox9Q04887 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sox9Q04887 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sox9Q04887 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sox9Q04887 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sox9Q04887 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sox9Q04887 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sox9Q04887 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sox9Q04887 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sox9Q04887 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sox9Q04887 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sox9Q04887 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sox9Q04887 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sox9Q04887 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sox9Q04887 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sox9Q04887 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sox9Q04887 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sox9Q04887 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sox9Q04887 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sox9Q04887 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sox9Q04887 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sox9Q04887 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sox9Q04887 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sox9Q04887 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sox9Q04887 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sox9Q04887 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sox9Q04887 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sox9Q04887 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sox9Q04887 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sox9Q04887 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sox9Q04887 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sox9Q04887 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sox9Q04887 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sox9Q04887 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sox9Q04887 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sox9Q04887 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sox9Q04887 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sox9Q04887 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sox9Q04887 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sox9Q04887 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sox9Q04887 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sox9Q04887 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Sox9Q04887 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sox9Q04887 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sox9Q04887 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sox9Q04887 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sox9Q04887 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sox9Q04887 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sox9Q04887 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sox9Q04887 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Sox9Q04887 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sox9Q04887 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sox9Q04887 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sox9Q04887 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sox9Q04887 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sox9Q04887 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sox9Q04887 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sox9Q04887 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sox9Q04887 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sox9Q04887 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sox9Q04887 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sox9Q04887 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sox9Q04887 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sox9Q04887 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sox9Q04887 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sox9Q04887 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sox9Q04887 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sox9Q04887 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sox9Q04887 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sox9Q04887 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sox9Q04887 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sox9Q04887 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms