Protein–RNA interactions for Protein: Q03526

Itk, Tyrosine-protein kinase ITK/TSK, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItkQ03526 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ItkQ03526 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ItkQ03526 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ItkQ03526 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ItkQ03526 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ItkQ03526 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ItkQ03526 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ItkQ03526 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ItkQ03526 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ItkQ03526 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ItkQ03526 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ItkQ03526 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ItkQ03526 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ItkQ03526 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ItkQ03526 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ItkQ03526 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ItkQ03526 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ItkQ03526 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ItkQ03526 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ItkQ03526 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ItkQ03526 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ItkQ03526 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ItkQ03526 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ItkQ03526 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ItkQ03526 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ItkQ03526 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ItkQ03526 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ItkQ03526 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ItkQ03526 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ItkQ03526 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ItkQ03526 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ItkQ03526 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ItkQ03526 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ItkQ03526 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ItkQ03526 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ItkQ03526 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ItkQ03526 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ItkQ03526 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ItkQ03526 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ItkQ03526 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ItkQ03526 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ItkQ03526 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ItkQ03526 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ItkQ03526 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ItkQ03526 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ItkQ03526 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ItkQ03526 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ItkQ03526 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ItkQ03526 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ItkQ03526 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ItkQ03526 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ItkQ03526 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ItkQ03526 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.01■■□□□ 1.6
ItkQ03526 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ItkQ03526 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ItkQ03526 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ItkQ03526 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ItkQ03526 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ItkQ03526 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ItkQ03526 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ItkQ03526 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ItkQ03526 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ItkQ03526 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ItkQ03526 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ItkQ03526 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ItkQ03526 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ItkQ03526 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ItkQ03526 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ItkQ03526 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ItkQ03526 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ItkQ03526 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ItkQ03526 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ItkQ03526 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ItkQ03526 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ItkQ03526 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ItkQ03526 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ItkQ03526 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ItkQ03526 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ItkQ03526 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ItkQ03526 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ItkQ03526 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ItkQ03526 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ItkQ03526 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ItkQ03526 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ItkQ03526 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ItkQ03526 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ItkQ03526 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ItkQ03526 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ItkQ03526 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ItkQ03526 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ItkQ03526 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ItkQ03526 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ItkQ03526 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ItkQ03526 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ItkQ03526 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ItkQ03526 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ItkQ03526 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ItkQ03526 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ItkQ03526 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ItkQ03526 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms