Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VcpQ01853 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VcpQ01853 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VcpQ01853 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VcpQ01853 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
VcpQ01853 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
VcpQ01853 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VcpQ01853 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VcpQ01853 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VcpQ01853 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
VcpQ01853 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VcpQ01853 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VcpQ01853 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VcpQ01853 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VcpQ01853 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VcpQ01853 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VcpQ01853 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
VcpQ01853 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VcpQ01853 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VcpQ01853 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VcpQ01853 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VcpQ01853 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VcpQ01853 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VcpQ01853 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VcpQ01853 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VcpQ01853 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VcpQ01853 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VcpQ01853 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VcpQ01853 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
VcpQ01853 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VcpQ01853 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VcpQ01853 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VcpQ01853 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VcpQ01853 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VcpQ01853 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VcpQ01853 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VcpQ01853 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VcpQ01853 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VcpQ01853 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VcpQ01853 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VcpQ01853 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VcpQ01853 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
VcpQ01853 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VcpQ01853 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VcpQ01853 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VcpQ01853 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VcpQ01853 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VcpQ01853 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VcpQ01853 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VcpQ01853 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VcpQ01853 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VcpQ01853 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VcpQ01853 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VcpQ01853 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VcpQ01853 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VcpQ01853 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VcpQ01853 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VcpQ01853 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VcpQ01853 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VcpQ01853 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VcpQ01853 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VcpQ01853 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VcpQ01853 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VcpQ01853 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VcpQ01853 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VcpQ01853 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VcpQ01853 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VcpQ01853 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VcpQ01853 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VcpQ01853 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VcpQ01853 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VcpQ01853 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VcpQ01853 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VcpQ01853 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VcpQ01853 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VcpQ01853 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VcpQ01853 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VcpQ01853 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
VcpQ01853 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VcpQ01853 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VcpQ01853 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VcpQ01853 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VcpQ01853 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VcpQ01853 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VcpQ01853 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VcpQ01853 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VcpQ01853 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VcpQ01853 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VcpQ01853 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VcpQ01853 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VcpQ01853 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VcpQ01853 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VcpQ01853 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
VcpQ01853 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VcpQ01853 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VcpQ01853 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VcpQ01853 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VcpQ01853 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VcpQ01853 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VcpQ01853 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms