Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd1Q01822 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd1Q01822 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd1Q01822 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd1Q01822 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd1Q01822 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd1Q01822 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd1Q01822 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd1Q01822 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd1Q01822 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd1Q01822 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd1Q01822 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd1Q01822 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd1Q01822 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd1Q01822 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd1Q01822 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd1Q01822 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd1Q01822 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd1Q01822 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd1Q01822 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd1Q01822 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd1Q01822 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd1Q01822 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd1Q01822 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxd1Q01822 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxd1Q01822 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd1Q01822 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd1Q01822 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd1Q01822 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd1Q01822 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd1Q01822 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd1Q01822 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd1Q01822 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd1Q01822 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd1Q01822 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd1Q01822 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd1Q01822 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd1Q01822 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd1Q01822 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxd1Q01822 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxd1Q01822 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxd1Q01822 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd1Q01822 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd1Q01822 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd1Q01822 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd1Q01822 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd1Q01822 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd1Q01822 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd1Q01822 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd1Q01822 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd1Q01822 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd1Q01822 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd1Q01822 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd1Q01822 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd1Q01822 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd1Q01822 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd1Q01822 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd1Q01822 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxd1Q01822 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxd1Q01822 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd1Q01822 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd1Q01822 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd1Q01822 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd1Q01822 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd1Q01822 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd1Q01822 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxd1Q01822 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd1Q01822 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd1Q01822 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd1Q01822 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd1Q01822 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd1Q01822 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd1Q01822 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd1Q01822 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd1Q01822 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd1Q01822 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd1Q01822 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd1Q01822 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd1Q01822 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd1Q01822 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd1Q01822 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd1Q01822 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd1Q01822 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd1Q01822 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd1Q01822 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd1Q01822 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxd1Q01822 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxd1Q01822 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxd1Q01822 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxd1Q01822 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxd1Q01822 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd1Q01822 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd1Q01822 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd1Q01822 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd1Q01822 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxd1Q01822 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxd1Q01822 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxd1Q01822 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd1Q01822 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd1Q01822 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms