Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Apoa1Q00623 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apoa1Q00623 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apoa1Q00623 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apoa1Q00623 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Apoa1Q00623 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apoa1Q00623 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apoa1Q00623 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apoa1Q00623 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apoa1Q00623 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apoa1Q00623 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apoa1Q00623 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apoa1Q00623 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apoa1Q00623 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apoa1Q00623 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apoa1Q00623 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apoa1Q00623 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apoa1Q00623 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apoa1Q00623 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apoa1Q00623 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apoa1Q00623 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apoa1Q00623 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apoa1Q00623 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apoa1Q00623 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apoa1Q00623 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Apoa1Q00623 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apoa1Q00623 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apoa1Q00623 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apoa1Q00623 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Apoa1Q00623 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apoa1Q00623 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apoa1Q00623 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apoa1Q00623 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apoa1Q00623 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apoa1Q00623 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Apoa1Q00623 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apoa1Q00623 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Apoa1Q00623 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apoa1Q00623 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apoa1Q00623 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Apoa1Q00623 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apoa1Q00623 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apoa1Q00623 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apoa1Q00623 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apoa1Q00623 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apoa1Q00623 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apoa1Q00623 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apoa1Q00623 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Apoa1Q00623 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apoa1Q00623 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apoa1Q00623 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apoa1Q00623 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Apoa1Q00623 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apoa1Q00623 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apoa1Q00623 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apoa1Q00623 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apoa1Q00623 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apoa1Q00623 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Apoa1Q00623 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apoa1Q00623 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apoa1Q00623 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apoa1Q00623 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apoa1Q00623 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apoa1Q00623 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apoa1Q00623 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apoa1Q00623 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apoa1Q00623 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apoa1Q00623 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apoa1Q00623 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apoa1Q00623 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apoa1Q00623 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apoa1Q00623 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apoa1Q00623 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apoa1Q00623 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apoa1Q00623 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apoa1Q00623 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apoa1Q00623 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apoa1Q00623 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apoa1Q00623 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apoa1Q00623 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apoa1Q00623 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apoa1Q00623 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apoa1Q00623 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apoa1Q00623 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apoa1Q00623 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apoa1Q00623 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apoa1Q00623 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apoa1Q00623 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apoa1Q00623 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apoa1Q00623 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apoa1Q00623 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apoa1Q00623 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apoa1Q00623 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apoa1Q00623 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apoa1Q00623 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apoa1Q00623 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apoa1Q00623 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apoa1Q00623 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apoa1Q00623 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apoa1Q00623 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms