Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VldlrP98156 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VldlrP98156 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VldlrP98156 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VldlrP98156 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VldlrP98156 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VldlrP98156 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VldlrP98156 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VldlrP98156 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VldlrP98156 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VldlrP98156 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VldlrP98156 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VldlrP98156 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VldlrP98156 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VldlrP98156 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VldlrP98156 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VldlrP98156 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VldlrP98156 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VldlrP98156 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VldlrP98156 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VldlrP98156 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VldlrP98156 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VldlrP98156 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VldlrP98156 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VldlrP98156 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VldlrP98156 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VldlrP98156 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VldlrP98156 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VldlrP98156 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VldlrP98156 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VldlrP98156 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VldlrP98156 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VldlrP98156 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VldlrP98156 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VldlrP98156 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VldlrP98156 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VldlrP98156 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VldlrP98156 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VldlrP98156 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VldlrP98156 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VldlrP98156 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VldlrP98156 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VldlrP98156 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VldlrP98156 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VldlrP98156 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VldlrP98156 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VldlrP98156 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VldlrP98156 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VldlrP98156 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VldlrP98156 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VldlrP98156 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VldlrP98156 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VldlrP98156 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VldlrP98156 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VldlrP98156 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VldlrP98156 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VldlrP98156 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VldlrP98156 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VldlrP98156 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VldlrP98156 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VldlrP98156 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VldlrP98156 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VldlrP98156 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VldlrP98156 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VldlrP98156 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VldlrP98156 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VldlrP98156 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VldlrP98156 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VldlrP98156 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VldlrP98156 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VldlrP98156 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VldlrP98156 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VldlrP98156 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VldlrP98156 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VldlrP98156 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VldlrP98156 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VldlrP98156 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VldlrP98156 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VldlrP98156 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VldlrP98156 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VldlrP98156 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VldlrP98156 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VldlrP98156 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VldlrP98156 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VldlrP98156 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VldlrP98156 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VldlrP98156 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VldlrP98156 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VldlrP98156 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VldlrP98156 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VldlrP98156 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VldlrP98156 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VldlrP98156 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VldlrP98156 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VldlrP98156 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VldlrP98156 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VldlrP98156 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VldlrP98156 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VldlrP98156 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VldlrP98156 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms