Protein–RNA interactions for Protein: P97461

Rps5, 40S ribosomal protein S5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps5P97461 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps5P97461 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps5P97461 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps5P97461 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps5P97461 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps5P97461 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps5P97461 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps5P97461 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps5P97461 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps5P97461 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps5P97461 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rps5P97461 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps5P97461 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps5P97461 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps5P97461 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps5P97461 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps5P97461 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps5P97461 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps5P97461 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps5P97461 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps5P97461 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps5P97461 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps5P97461 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps5P97461 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps5P97461 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps5P97461 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps5P97461 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps5P97461 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps5P97461 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps5P97461 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps5P97461 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps5P97461 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps5P97461 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps5P97461 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps5P97461 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps5P97461 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps5P97461 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps5P97461 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps5P97461 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps5P97461 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps5P97461 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps5P97461 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps5P97461 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps5P97461 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps5P97461 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps5P97461 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps5P97461 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps5P97461 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps5P97461 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps5P97461 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps5P97461 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rps5P97461 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps5P97461 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps5P97461 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps5P97461 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps5P97461 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps5P97461 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps5P97461 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps5P97461 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps5P97461 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps5P97461 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps5P97461 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps5P97461 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps5P97461 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps5P97461 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps5P97461 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps5P97461 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps5P97461 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps5P97461 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rps5P97461 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rps5P97461 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rps5P97461 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rps5P97461 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps5P97461 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps5P97461 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps5P97461 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps5P97461 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps5P97461 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps5P97461 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps5P97461 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps5P97461 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps5P97461 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps5P97461 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps5P97461 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps5P97461 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps5P97461 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps5P97461 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps5P97461 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps5P97461 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rps5P97461 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps5P97461 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps5P97461 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps5P97461 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps5P97461 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps5P97461 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps5P97461 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps5P97461 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps5P97461 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps5P97461 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps5P97461 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms