Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vgll3P85442 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vgll3P85442 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vgll3P85442 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vgll3P85442 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vgll3P85442 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vgll3P85442 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vgll3P85442 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vgll3P85442 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vgll3P85442 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vgll3P85442 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vgll3P85442 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vgll3P85442 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vgll3P85442 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vgll3P85442 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vgll3P85442 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vgll3P85442 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vgll3P85442 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vgll3P85442 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vgll3P85442 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vgll3P85442 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vgll3P85442 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vgll3P85442 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vgll3P85442 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vgll3P85442 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vgll3P85442 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vgll3P85442 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vgll3P85442 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vgll3P85442 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vgll3P85442 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Vgll3P85442 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vgll3P85442 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vgll3P85442 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vgll3P85442 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vgll3P85442 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vgll3P85442 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vgll3P85442 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vgll3P85442 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vgll3P85442 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vgll3P85442 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vgll3P85442 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vgll3P85442 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Vgll3P85442 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vgll3P85442 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vgll3P85442 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vgll3P85442 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vgll3P85442 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vgll3P85442 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vgll3P85442 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
Vgll3P85442 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Vgll3P85442 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vgll3P85442 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vgll3P85442 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vgll3P85442 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vgll3P85442 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vgll3P85442 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vgll3P85442 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vgll3P85442 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vgll3P85442 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vgll3P85442 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vgll3P85442 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vgll3P85442 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vgll3P85442 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vgll3P85442 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vgll3P85442 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vgll3P85442 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vgll3P85442 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vgll3P85442 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vgll3P85442 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vgll3P85442 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vgll3P85442 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vgll3P85442 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vgll3P85442 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vgll3P85442 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vgll3P85442 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vgll3P85442 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vgll3P85442 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vgll3P85442 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vgll3P85442 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vgll3P85442 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vgll3P85442 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vgll3P85442 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vgll3P85442 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vgll3P85442 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vgll3P85442 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Vgll3P85442 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vgll3P85442 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vgll3P85442 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vgll3P85442 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vgll3P85442 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vgll3P85442 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Vgll3P85442 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vgll3P85442 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vgll3P85442 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Vgll3P85442 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vgll3P85442 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vgll3P85442 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vgll3P85442 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vgll3P85442 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vgll3P85442 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms