Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbx1P82976 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbx1P82976 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gbx1P82976 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gbx1P82976 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbx1P82976 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbx1P82976 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbx1P82976 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbx1P82976 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbx1P82976 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbx1P82976 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbx1P82976 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbx1P82976 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbx1P82976 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbx1P82976 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbx1P82976 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbx1P82976 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbx1P82976 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbx1P82976 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbx1P82976 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbx1P82976 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbx1P82976 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbx1P82976 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbx1P82976 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbx1P82976 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbx1P82976 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbx1P82976 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbx1P82976 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbx1P82976 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbx1P82976 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbx1P82976 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbx1P82976 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbx1P82976 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbx1P82976 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbx1P82976 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbx1P82976 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbx1P82976 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbx1P82976 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbx1P82976 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gbx1P82976 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gbx1P82976 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gbx1P82976 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gbx1P82976 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbx1P82976 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbx1P82976 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbx1P82976 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbx1P82976 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbx1P82976 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbx1P82976 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbx1P82976 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gbx1P82976 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gbx1P82976 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gbx1P82976 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gbx1P82976 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gbx1P82976 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbx1P82976 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbx1P82976 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbx1P82976 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbx1P82976 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gbx1P82976 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gbx1P82976 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gbx1P82976 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gbx1P82976 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbx1P82976 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbx1P82976 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbx1P82976 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbx1P82976 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbx1P82976 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbx1P82976 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbx1P82976 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbx1P82976 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbx1P82976 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gbx1P82976 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gbx1P82976 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gbx1P82976 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbx1P82976 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gbx1P82976 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gbx1P82976 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gbx1P82976 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gbx1P82976 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbx1P82976 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbx1P82976 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbx1P82976 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbx1P82976 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbx1P82976 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbx1P82976 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbx1P82976 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbx1P82976 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbx1P82976 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbx1P82976 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbx1P82976 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbx1P82976 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbx1P82976 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbx1P82976 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbx1P82976 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbx1P82976 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbx1P82976 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gbx1P82976 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbx1P82976 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbx1P82976 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms