Protein–RNA interactions for Protein: P80313

Cct7, T-complex protein 1 subunit eta, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct7P80313 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cct7P80313 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cct7P80313 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cct7P80313 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cct7P80313 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cct7P80313 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cct7P80313 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cct7P80313 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cct7P80313 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cct7P80313 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cct7P80313 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cct7P80313 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cct7P80313 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cct7P80313 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cct7P80313 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cct7P80313 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cct7P80313 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cct7P80313 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cct7P80313 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cct7P80313 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cct7P80313 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cct7P80313 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cct7P80313 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cct7P80313 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cct7P80313 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cct7P80313 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cct7P80313 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cct7P80313 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cct7P80313 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cct7P80313 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cct7P80313 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cct7P80313 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cct7P80313 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cct7P80313 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cct7P80313 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cct7P80313 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cct7P80313 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cct7P80313 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cct7P80313 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cct7P80313 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cct7P80313 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cct7P80313 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cct7P80313 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cct7P80313 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cct7P80313 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cct7P80313 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cct7P80313 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cct7P80313 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cct7P80313 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cct7P80313 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cct7P80313 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cct7P80313 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cct7P80313 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cct7P80313 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cct7P80313 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cct7P80313 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cct7P80313 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cct7P80313 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cct7P80313 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cct7P80313 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cct7P80313 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cct7P80313 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cct7P80313 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cct7P80313 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cct7P80313 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cct7P80313 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cct7P80313 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cct7P80313 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cct7P80313 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cct7P80313 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cct7P80313 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cct7P80313 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cct7P80313 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cct7P80313 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cct7P80313 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cct7P80313 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cct7P80313 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cct7P80313 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cct7P80313 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cct7P80313 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cct7P80313 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cct7P80313 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cct7P80313 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cct7P80313 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cct7P80313 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cct7P80313 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cct7P80313 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cct7P80313 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cct7P80313 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cct7P80313 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cct7P80313 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cct7P80313 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cct7P80313 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cct7P80313 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cct7P80313 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cct7P80313 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cct7P80313 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cct7P80313 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cct7P80313 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cct7P80313 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms