Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gjb6P70689 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gjb6P70689 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gjb6P70689 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gjb6P70689 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Gjb6P70689 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gjb6P70689 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gjb6P70689 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gjb6P70689 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Gjb6P70689 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Gjb6P70689 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gjb6P70689 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gjb6P70689 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gjb6P70689 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gjb6P70689 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gjb6P70689 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gjb6P70689 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gjb6P70689 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Gjb6P70689 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gjb6P70689 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Gjb6P70689 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gjb6P70689 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gjb6P70689 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gjb6P70689 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gjb6P70689 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gjb6P70689 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gjb6P70689 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gjb6P70689 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gjb6P70689 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gjb6P70689 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gjb6P70689 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gjb6P70689 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gjb6P70689 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gjb6P70689 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gjb6P70689 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gjb6P70689 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gjb6P70689 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Gjb6P70689 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gjb6P70689 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gjb6P70689 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gjb6P70689 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gjb6P70689 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gjb6P70689 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gjb6P70689 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gjb6P70689 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gjb6P70689 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Gjb6P70689 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gjb6P70689 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gjb6P70689 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gjb6P70689 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gjb6P70689 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gjb6P70689 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gjb6P70689 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gjb6P70689 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gjb6P70689 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gjb6P70689 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gjb6P70689 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gjb6P70689 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gjb6P70689 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gjb6P70689 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gjb6P70689 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gjb6P70689 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gjb6P70689 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gjb6P70689 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gjb6P70689 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gjb6P70689 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gjb6P70689 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gjb6P70689 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gjb6P70689 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gjb6P70689 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gjb6P70689 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gjb6P70689 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gjb6P70689 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gjb6P70689 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gjb6P70689 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gjb6P70689 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gjb6P70689 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gjb6P70689 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gjb6P70689 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gjb6P70689 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gjb6P70689 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gjb6P70689 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gjb6P70689 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gjb6P70689 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gjb6P70689 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gjb6P70689 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gjb6P70689 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gjb6P70689 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gjb6P70689 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gjb6P70689 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gjb6P70689 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gjb6P70689 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gjb6P70689 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gjb6P70689 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gjb6P70689 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gjb6P70689 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gjb6P70689 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gjb6P70689 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gjb6P70689 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gjb6P70689 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms