Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ldb1P70662 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ldb1P70662 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ldb1P70662 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ldb1P70662 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ldb1P70662 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ldb1P70662 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ldb1P70662 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ldb1P70662 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ldb1P70662 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ldb1P70662 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ldb1P70662 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ldb1P70662 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ldb1P70662 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ldb1P70662 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ldb1P70662 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ldb1P70662 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ldb1P70662 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ldb1P70662 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ldb1P70662 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ldb1P70662 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ldb1P70662 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ldb1P70662 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ldb1P70662 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ldb1P70662 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ldb1P70662 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ldb1P70662 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ldb1P70662 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ldb1P70662 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ldb1P70662 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ldb1P70662 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ldb1P70662 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ldb1P70662 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ldb1P70662 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ldb1P70662 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ldb1P70662 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ldb1P70662 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ldb1P70662 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ldb1P70662 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ldb1P70662 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ldb1P70662 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ldb1P70662 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ldb1P70662 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ldb1P70662 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ldb1P70662 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ldb1P70662 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ldb1P70662 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ldb1P70662 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ldb1P70662 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ldb1P70662 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ldb1P70662 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ldb1P70662 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ldb1P70662 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ldb1P70662 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ldb1P70662 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ldb1P70662 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ldb1P70662 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ldb1P70662 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ldb1P70662 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ldb1P70662 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ldb1P70662 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ldb1P70662 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ldb1P70662 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ldb1P70662 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ldb1P70662 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ldb1P70662 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ldb1P70662 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ldb1P70662 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ldb1P70662 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ldb1P70662 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ldb1P70662 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ldb1P70662 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ldb1P70662 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ldb1P70662 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ldb1P70662 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ldb1P70662 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ldb1P70662 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ldb1P70662 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ldb1P70662 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ldb1P70662 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ldb1P70662 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ldb1P70662 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ldb1P70662 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ldb1P70662 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ldb1P70662 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ldb1P70662 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ldb1P70662 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ldb1P70662 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ldb1P70662 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ldb1P70662 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ldb1P70662 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ldb1P70662 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ldb1P70662 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ldb1P70662 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ldb1P70662 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ldb1P70662 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ldb1P70662 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ldb1P70662 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ldb1P70662 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ldb1P70662 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms