Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cxcr4P70658 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cxcr4P70658 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cxcr4P70658 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cxcr4P70658 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cxcr4P70658 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cxcr4P70658 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cxcr4P70658 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cxcr4P70658 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cxcr4P70658 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cxcr4P70658 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cxcr4P70658 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cxcr4P70658 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cxcr4P70658 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cxcr4P70658 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cxcr4P70658 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cxcr4P70658 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cxcr4P70658 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cxcr4P70658 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cxcr4P70658 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cxcr4P70658 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cxcr4P70658 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cxcr4P70658 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcr4P70658 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcr4P70658 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcr4P70658 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcr4P70658 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcr4P70658 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcr4P70658 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cxcr4P70658 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cxcr4P70658 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cxcr4P70658 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cxcr4P70658 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxcr4P70658 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cxcr4P70658 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cxcr4P70658 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cxcr4P70658 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxcr4P70658 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxcr4P70658 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxcr4P70658 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxcr4P70658 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxcr4P70658 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cxcr4P70658 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxcr4P70658 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxcr4P70658 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxcr4P70658 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxcr4P70658 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cxcr4P70658 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cxcr4P70658 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cxcr4P70658 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cxcr4P70658 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cxcr4P70658 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cxcr4P70658 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cxcr4P70658 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cxcr4P70658 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cxcr4P70658 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcr4P70658 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcr4P70658 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcr4P70658 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcr4P70658 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcr4P70658 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcr4P70658 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcr4P70658 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cxcr4P70658 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cxcr4P70658 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cxcr4P70658 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cxcr4P70658 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cxcr4P70658 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cxcr4P70658 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cxcr4P70658 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cxcr4P70658 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxcr4P70658 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxcr4P70658 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxcr4P70658 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxcr4P70658 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cxcr4P70658 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cxcr4P70658 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cxcr4P70658 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cxcr4P70658 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cxcr4P70658 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cxcr4P70658 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cxcr4P70658 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cxcr4P70658 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cxcr4P70658 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cxcr4P70658 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cxcr4P70658 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxcr4P70658 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxcr4P70658 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cxcr4P70658 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cxcr4P70658 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cxcr4P70658 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cxcr4P70658 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxcr4P70658 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxcr4P70658 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxcr4P70658 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxcr4P70658 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cxcr4P70658 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cxcr4P70658 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cxcr4P70658 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cxcr4P70658 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms