Protein–RNA interactions for Protein: P70424

Erbb2, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb2P70424 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Erbb2P70424 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Erbb2P70424 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Erbb2P70424 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Erbb2P70424 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Erbb2P70424 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28,07■■■□□ 2,08
Erbb2P70424 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Erbb2P70424 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Erbb2P70424 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Erbb2P70424 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Erbb2P70424 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Erbb2P70424 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Erbb2P70424 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28,02■■■□□ 2,08
Erbb2P70424 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Erbb2P70424 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Erbb2P70424 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Erbb2P70424 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2,07
Erbb2P70424 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Erbb2P70424 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Erbb2P70424 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Erbb2P70424 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Erbb2P70424 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Erbb2P70424 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Erbb2P70424 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Erbb2P70424 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Erbb2P70424 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Erbb2P70424 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Erbb2P70424 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Erbb2P70424 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Erbb2P70424 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Erbb2P70424 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Erbb2P70424 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Erbb2P70424 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27,87■■■□□ 2,05
Erbb2P70424 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Erbb2P70424 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Erbb2P70424 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Erbb2P70424 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Erbb2P70424 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Erbb2P70424 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Erbb2P70424 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Erbb2P70424 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Erbb2P70424 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Erbb2P70424 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27,79■■■□□ 2,04
Erbb2P70424 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Erbb2P70424 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Erbb2P70424 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Erbb2P70424 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Erbb2P70424 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Erbb2P70424 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Erbb2P70424 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Erbb2P70424 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Erbb2P70424 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Erbb2P70424 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Erbb2P70424 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Erbb2P70424 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Erbb2P70424 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Erbb2P70424 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Erbb2P70424 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Erbb2P70424 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Erbb2P70424 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Erbb2P70424 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Erbb2P70424 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27,71■■■□□ 2,03
Erbb2P70424 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Erbb2P70424 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Erbb2P70424 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Erbb2P70424 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Erbb2P70424 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Erbb2P70424 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Erbb2P70424 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Erbb2P70424 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Erbb2P70424 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Erbb2P70424 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Erbb2P70424 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Erbb2P70424 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Erbb2P70424 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Erbb2P70424 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Erbb2P70424 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Erbb2P70424 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,57■■■□□ 2
Erbb2P70424 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27,57■■■□□ 2
Erbb2P70424 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27,56■■■□□ 2
Erbb2P70424 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Erbb2P70424 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Erbb2P70424 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Erbb2P70424 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Erbb2P70424 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Erbb2P70424 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,53■■■□□ 2
Erbb2P70424 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,53■■■□□ 2
Erbb2P70424 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Erbb2P70424 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
Erbb2P70424 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Erbb2P70424 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Erbb2P70424 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Erbb2P70424 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,5■■□□□ 1,99
Erbb2P70424 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27,49■■□□□ 1,99
Erbb2P70424 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Erbb2P70424 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Erbb2P70424 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Erbb2P70424 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Erbb2P70424 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Erbb2P70424 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,2 ms