Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc8a1P70414 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc8a1P70414 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc8a1P70414 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc8a1P70414 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc8a1P70414 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc8a1P70414 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc8a1P70414 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc8a1P70414 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc8a1P70414 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc8a1P70414 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc8a1P70414 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc8a1P70414 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc8a1P70414 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc8a1P70414 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc8a1P70414 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc8a1P70414 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc8a1P70414 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slc8a1P70414 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slc8a1P70414 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slc8a1P70414 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc8a1P70414 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc8a1P70414 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc8a1P70414 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc8a1P70414 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc8a1P70414 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc8a1P70414 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc8a1P70414 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc8a1P70414 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc8a1P70414 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc8a1P70414 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc8a1P70414 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc8a1P70414 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc8a1P70414 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc8a1P70414 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc8a1P70414 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc8a1P70414 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc8a1P70414 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc8a1P70414 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc8a1P70414 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc8a1P70414 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc8a1P70414 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc8a1P70414 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc8a1P70414 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc8a1P70414 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc8a1P70414 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc8a1P70414 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc8a1P70414 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc8a1P70414 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc8a1P70414 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc8a1P70414 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc8a1P70414 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc8a1P70414 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc8a1P70414 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc8a1P70414 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc8a1P70414 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc8a1P70414 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc8a1P70414 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc8a1P70414 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc8a1P70414 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc8a1P70414 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc8a1P70414 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc8a1P70414 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc8a1P70414 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc8a1P70414 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc8a1P70414 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc8a1P70414 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc8a1P70414 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc8a1P70414 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc8a1P70414 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc8a1P70414 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc8a1P70414 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc8a1P70414 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc8a1P70414 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc8a1P70414 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc8a1P70414 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc8a1P70414 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc8a1P70414 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc8a1P70414 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc8a1P70414 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc8a1P70414 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc8a1P70414 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc8a1P70414 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc8a1P70414 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc8a1P70414 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc8a1P70414 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc8a1P70414 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc8a1P70414 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc8a1P70414 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc8a1P70414 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc8a1P70414 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc8a1P70414 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc8a1P70414 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc8a1P70414 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc8a1P70414 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc8a1P70414 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc8a1P70414 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc8a1P70414 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc8a1P70414 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc8a1P70414 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms