Protein–RNA interactions for Protein: P70408

Cdh10, Cadherin-10, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh10P70408 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh10P70408 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh10P70408 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh10P70408 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh10P70408 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh10P70408 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh10P70408 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh10P70408 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh10P70408 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh10P70408 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh10P70408 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh10P70408 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh10P70408 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh10P70408 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh10P70408 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh10P70408 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh10P70408 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh10P70408 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh10P70408 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh10P70408 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh10P70408 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh10P70408 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh10P70408 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh10P70408 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh10P70408 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh10P70408 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh10P70408 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh10P70408 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh10P70408 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh10P70408 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh10P70408 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh10P70408 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh10P70408 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh10P70408 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh10P70408 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh10P70408 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh10P70408 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh10P70408 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh10P70408 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh10P70408 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh10P70408 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh10P70408 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh10P70408 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdh10P70408 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh10P70408 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh10P70408 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh10P70408 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh10P70408 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh10P70408 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh10P70408 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh10P70408 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh10P70408 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh10P70408 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh10P70408 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh10P70408 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh10P70408 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh10P70408 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh10P70408 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh10P70408 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh10P70408 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh10P70408 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh10P70408 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh10P70408 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh10P70408 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh10P70408 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh10P70408 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh10P70408 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh10P70408 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh10P70408 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh10P70408 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh10P70408 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh10P70408 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh10P70408 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh10P70408 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh10P70408 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh10P70408 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh10P70408 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh10P70408 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh10P70408 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh10P70408 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh10P70408 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh10P70408 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh10P70408 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh10P70408 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh10P70408 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh10P70408 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdh10P70408 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh10P70408 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh10P70408 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh10P70408 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh10P70408 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh10P70408 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh10P70408 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh10P70408 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh10P70408 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh10P70408 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh10P70408 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh10P70408 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh10P70408 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh10P70408 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms