Protein–RNA interactions for Protein: P70407

Cdh9, Cadherin-9, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh9P70407 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdh9P70407 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cdh9P70407 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdh9P70407 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdh9P70407 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdh9P70407 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdh9P70407 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdh9P70407 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdh9P70407 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdh9P70407 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdh9P70407 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdh9P70407 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdh9P70407 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdh9P70407 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdh9P70407 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdh9P70407 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdh9P70407 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdh9P70407 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdh9P70407 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdh9P70407 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdh9P70407 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdh9P70407 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdh9P70407 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdh9P70407 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdh9P70407 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdh9P70407 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdh9P70407 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdh9P70407 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdh9P70407 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdh9P70407 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdh9P70407 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdh9P70407 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdh9P70407 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdh9P70407 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdh9P70407 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdh9P70407 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdh9P70407 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdh9P70407 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdh9P70407 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdh9P70407 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdh9P70407 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdh9P70407 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdh9P70407 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdh9P70407 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdh9P70407 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdh9P70407 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdh9P70407 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdh9P70407 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdh9P70407 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdh9P70407 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdh9P70407 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdh9P70407 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdh9P70407 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdh9P70407 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdh9P70407 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdh9P70407 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdh9P70407 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdh9P70407 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdh9P70407 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdh9P70407 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdh9P70407 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cdh9P70407 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdh9P70407 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdh9P70407 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdh9P70407 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdh9P70407 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdh9P70407 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdh9P70407 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdh9P70407 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdh9P70407 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdh9P70407 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdh9P70407 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdh9P70407 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdh9P70407 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdh9P70407 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdh9P70407 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdh9P70407 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdh9P70407 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdh9P70407 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Cdh9P70407 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdh9P70407 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdh9P70407 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdh9P70407 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdh9P70407 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdh9P70407 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdh9P70407 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdh9P70407 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdh9P70407 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdh9P70407 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdh9P70407 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdh9P70407 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdh9P70407 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cdh9P70407 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdh9P70407 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdh9P70407 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdh9P70407 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdh9P70407 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdh9P70407 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdh9P70407 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdh9P70407 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms