Protein–RNA interactions for Protein: P70288

Hdac2, Histone deacetylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac2P70288 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac2P70288 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac2P70288 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac2P70288 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac2P70288 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac2P70288 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac2P70288 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac2P70288 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac2P70288 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac2P70288 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac2P70288 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac2P70288 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac2P70288 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac2P70288 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac2P70288 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac2P70288 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac2P70288 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac2P70288 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac2P70288 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac2P70288 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hdac2P70288 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hdac2P70288 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac2P70288 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac2P70288 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac2P70288 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac2P70288 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac2P70288 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac2P70288 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac2P70288 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac2P70288 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac2P70288 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hdac2P70288 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac2P70288 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac2P70288 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac2P70288 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac2P70288 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac2P70288 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac2P70288 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac2P70288 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac2P70288 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac2P70288 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac2P70288 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac2P70288 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac2P70288 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac2P70288 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac2P70288 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hdac2P70288 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac2P70288 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac2P70288 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac2P70288 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac2P70288 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac2P70288 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac2P70288 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac2P70288 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac2P70288 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac2P70288 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac2P70288 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac2P70288 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac2P70288 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac2P70288 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac2P70288 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac2P70288 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac2P70288 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac2P70288 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac2P70288 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac2P70288 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac2P70288 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac2P70288 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac2P70288 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac2P70288 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac2P70288 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac2P70288 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac2P70288 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac2P70288 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac2P70288 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac2P70288 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac2P70288 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac2P70288 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac2P70288 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac2P70288 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac2P70288 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac2P70288 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac2P70288 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac2P70288 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac2P70288 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac2P70288 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac2P70288 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac2P70288 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac2P70288 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac2P70288 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac2P70288 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac2P70288 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac2P70288 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac2P70288 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac2P70288 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac2P70288 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac2P70288 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac2P70288 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac2P70288 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac2P70288 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms