Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NficP70255 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NficP70255 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NficP70255 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NficP70255 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NficP70255 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NficP70255 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NficP70255 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NficP70255 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NficP70255 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NficP70255 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NficP70255 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NficP70255 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NficP70255 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NficP70255 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NficP70255 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NficP70255 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NficP70255 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NficP70255 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NficP70255 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NficP70255 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NficP70255 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NficP70255 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NficP70255 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NficP70255 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NficP70255 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NficP70255 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NficP70255 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NficP70255 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NficP70255 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NficP70255 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NficP70255 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NficP70255 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NficP70255 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NficP70255 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NficP70255 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NficP70255 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NficP70255 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NficP70255 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NficP70255 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NficP70255 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NficP70255 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NficP70255 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NficP70255 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NficP70255 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NficP70255 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NficP70255 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NficP70255 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NficP70255 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NficP70255 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NficP70255 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NficP70255 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NficP70255 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NficP70255 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NficP70255 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NficP70255 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NficP70255 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NficP70255 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NficP70255 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NficP70255 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NficP70255 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NficP70255 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NficP70255 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NficP70255 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NficP70255 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NficP70255 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NficP70255 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NficP70255 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NficP70255 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NficP70255 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NficP70255 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NficP70255 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NficP70255 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NficP70255 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NficP70255 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NficP70255 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NficP70255 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NficP70255 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NficP70255 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NficP70255 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NficP70255 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NficP70255 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NficP70255 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NficP70255 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NficP70255 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NficP70255 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NficP70255 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NficP70255 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NficP70255 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NficP70255 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NficP70255 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NficP70255 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NficP70255 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NficP70255 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NficP70255 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NficP70255 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NficP70255 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NficP70255 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NficP70255 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NficP70255 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms