Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Traf5P70191 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Traf5P70191 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Traf5P70191 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Traf5P70191 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Traf5P70191 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Traf5P70191 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Traf5P70191 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Traf5P70191 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Traf5P70191 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Traf5P70191 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Traf5P70191 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Traf5P70191 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Traf5P70191 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Traf5P70191 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Traf5P70191 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Traf5P70191 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Traf5P70191 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Traf5P70191 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Traf5P70191 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Traf5P70191 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Traf5P70191 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Traf5P70191 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Traf5P70191 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Traf5P70191 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Traf5P70191 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Traf5P70191 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Traf5P70191 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Traf5P70191 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Traf5P70191 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Traf5P70191 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Traf5P70191 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Traf5P70191 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Traf5P70191 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Traf5P70191 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Traf5P70191 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Traf5P70191 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Traf5P70191 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Traf5P70191 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Traf5P70191 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Traf5P70191 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Traf5P70191 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Traf5P70191 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Traf5P70191 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Traf5P70191 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Traf5P70191 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Traf5P70191 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Traf5P70191 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Traf5P70191 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Traf5P70191 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Traf5P70191 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Traf5P70191 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Traf5P70191 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Traf5P70191 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Traf5P70191 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Traf5P70191 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Traf5P70191 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Traf5P70191 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Traf5P70191 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Traf5P70191 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Traf5P70191 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Traf5P70191 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Traf5P70191 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Traf5P70191 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Traf5P70191 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Traf5P70191 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Traf5P70191 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Traf5P70191 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Traf5P70191 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Traf5P70191 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Traf5P70191 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Traf5P70191 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Traf5P70191 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Traf5P70191 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Traf5P70191 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Traf5P70191 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Traf5P70191 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Traf5P70191 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Traf5P70191 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Traf5P70191 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Traf5P70191 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Traf5P70191 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Traf5P70191 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Traf5P70191 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Traf5P70191 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Traf5P70191 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Traf5P70191 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Traf5P70191 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Traf5P70191 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Traf5P70191 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Traf5P70191 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Traf5P70191 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Traf5P70191 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Traf5P70191 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Traf5P70191 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Traf5P70191 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Traf5P70191 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Traf5P70191 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Traf5P70191 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Traf5P70191 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms