Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SbdsP70122 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SbdsP70122 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SbdsP70122 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SbdsP70122 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SbdsP70122 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SbdsP70122 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SbdsP70122 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SbdsP70122 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SbdsP70122 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SbdsP70122 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SbdsP70122 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SbdsP70122 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SbdsP70122 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SbdsP70122 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SbdsP70122 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SbdsP70122 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SbdsP70122 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SbdsP70122 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SbdsP70122 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SbdsP70122 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SbdsP70122 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SbdsP70122 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SbdsP70122 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SbdsP70122 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SbdsP70122 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SbdsP70122 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SbdsP70122 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SbdsP70122 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SbdsP70122 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SbdsP70122 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SbdsP70122 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SbdsP70122 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SbdsP70122 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SbdsP70122 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SbdsP70122 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SbdsP70122 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SbdsP70122 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SbdsP70122 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SbdsP70122 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SbdsP70122 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SbdsP70122 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SbdsP70122 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SbdsP70122 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SbdsP70122 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SbdsP70122 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SbdsP70122 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SbdsP70122 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SbdsP70122 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SbdsP70122 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SbdsP70122 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SbdsP70122 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SbdsP70122 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SbdsP70122 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SbdsP70122 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SbdsP70122 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SbdsP70122 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SbdsP70122 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SbdsP70122 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SbdsP70122 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SbdsP70122 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SbdsP70122 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SbdsP70122 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SbdsP70122 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SbdsP70122 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SbdsP70122 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SbdsP70122 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SbdsP70122 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SbdsP70122 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SbdsP70122 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SbdsP70122 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SbdsP70122 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SbdsP70122 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SbdsP70122 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SbdsP70122 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SbdsP70122 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SbdsP70122 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SbdsP70122 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SbdsP70122 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SbdsP70122 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SbdsP70122 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SbdsP70122 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SbdsP70122 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SbdsP70122 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SbdsP70122 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SbdsP70122 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SbdsP70122 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SbdsP70122 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SbdsP70122 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SbdsP70122 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SbdsP70122 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SbdsP70122 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SbdsP70122 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SbdsP70122 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SbdsP70122 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SbdsP70122 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SbdsP70122 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SbdsP70122 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SbdsP70122 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SbdsP70122 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms