Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtnP63089 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtnP63089 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtnP63089 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtnP63089 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtnP63089 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtnP63089 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtnP63089 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtnP63089 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtnP63089 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtnP63089 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtnP63089 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtnP63089 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtnP63089 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtnP63089 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtnP63089 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtnP63089 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtnP63089 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtnP63089 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtnP63089 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtnP63089 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtnP63089 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtnP63089 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtnP63089 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PtnP63089 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtnP63089 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtnP63089 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtnP63089 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtnP63089 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtnP63089 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtnP63089 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtnP63089 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtnP63089 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtnP63089 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtnP63089 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtnP63089 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtnP63089 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtnP63089 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtnP63089 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtnP63089 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PtnP63089 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtnP63089 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtnP63089 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtnP63089 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtnP63089 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtnP63089 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtnP63089 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtnP63089 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PtnP63089 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtnP63089 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtnP63089 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtnP63089 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtnP63089 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtnP63089 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtnP63089 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtnP63089 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtnP63089 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PtnP63089 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtnP63089 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtnP63089 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtnP63089 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtnP63089 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtnP63089 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtnP63089 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtnP63089 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtnP63089 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtnP63089 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PtnP63089 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtnP63089 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtnP63089 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtnP63089 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtnP63089 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtnP63089 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtnP63089 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtnP63089 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtnP63089 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtnP63089 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtnP63089 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtnP63089 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtnP63089 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtnP63089 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtnP63089 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtnP63089 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtnP63089 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtnP63089 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtnP63089 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtnP63089 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtnP63089 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtnP63089 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtnP63089 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtnP63089 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtnP63089 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtnP63089 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtnP63089 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtnP63089 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtnP63089 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtnP63089 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtnP63089 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtnP63089 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtnP63089 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms