Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps27aP62983 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps27aP62983 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rps27aP62983 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rps27aP62983 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps27aP62983 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps27aP62983 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rps27aP62983 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps27aP62983 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps27aP62983 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rps27aP62983 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rps27aP62983 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rps27aP62983 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rps27aP62983 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps27aP62983 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps27aP62983 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps27aP62983 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps27aP62983 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps27aP62983 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps27aP62983 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps27aP62983 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps27aP62983 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps27aP62983 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps27aP62983 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps27aP62983 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps27aP62983 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps27aP62983 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps27aP62983 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps27aP62983 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps27aP62983 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps27aP62983 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps27aP62983 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps27aP62983 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps27aP62983 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps27aP62983 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps27aP62983 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps27aP62983 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps27aP62983 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps27aP62983 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps27aP62983 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps27aP62983 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps27aP62983 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps27aP62983 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps27aP62983 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps27aP62983 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps27aP62983 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps27aP62983 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps27aP62983 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps27aP62983 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps27aP62983 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps27aP62983 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps27aP62983 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps27aP62983 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps27aP62983 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps27aP62983 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps27aP62983 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps27aP62983 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps27aP62983 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps27aP62983 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps27aP62983 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps27aP62983 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps27aP62983 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps27aP62983 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps27aP62983 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps27aP62983 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps27aP62983 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps27aP62983 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps27aP62983 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps27aP62983 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rps27aP62983 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps27aP62983 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps27aP62983 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps27aP62983 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps27aP62983 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps27aP62983 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps27aP62983 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps27aP62983 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps27aP62983 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps27aP62983 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps27aP62983 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps27aP62983 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps27aP62983 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps27aP62983 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps27aP62983 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rps27aP62983 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps27aP62983 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps27aP62983 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps27aP62983 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps27aP62983 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps27aP62983 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps27aP62983 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps27aP62983 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps27aP62983 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps27aP62983 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps27aP62983 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps27aP62983 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps27aP62983 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rps27aP62983 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rps27aP62983 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rps27aP62983 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms