Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gabra1P62812 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gabra1P62812 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gabra1P62812 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gabra1P62812 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gabra1P62812 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gabra1P62812 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gabra1P62812 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gabra1P62812 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gabra1P62812 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabra1P62812 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabra1P62812 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabra1P62812 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gabra1P62812 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabra1P62812 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabra1P62812 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabra1P62812 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabra1P62812 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabra1P62812 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabra1P62812 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabra1P62812 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabra1P62812 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabra1P62812 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabra1P62812 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabra1P62812 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabra1P62812 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabra1P62812 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gabra1P62812 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gabra1P62812 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gabra1P62812 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gabra1P62812 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gabra1P62812 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gabra1P62812 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gabra1P62812 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gabra1P62812 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gabra1P62812 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gabra1P62812 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gabra1P62812 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gabra1P62812 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gabra1P62812 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gabra1P62812 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gabra1P62812 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gabra1P62812 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabra1P62812 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabra1P62812 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabra1P62812 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabra1P62812 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabra1P62812 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabra1P62812 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabra1P62812 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabra1P62812 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabra1P62812 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabra1P62812 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabra1P62812 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabra1P62812 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabra1P62812 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabra1P62812 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabra1P62812 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabra1P62812 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabra1P62812 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabra1P62812 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabra1P62812 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabra1P62812 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabra1P62812 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabra1P62812 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabra1P62812 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabra1P62812 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabra1P62812 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabra1P62812 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabra1P62812 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabra1P62812 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabra1P62812 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabra1P62812 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabra1P62812 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabra1P62812 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabra1P62812 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabra1P62812 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabra1P62812 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabra1P62812 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabra1P62812 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gabra1P62812 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabra1P62812 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabra1P62812 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabra1P62812 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabra1P62812 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabra1P62812 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabra1P62812 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabra1P62812 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabra1P62812 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabra1P62812 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabra1P62812 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabra1P62812 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabra1P62812 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabra1P62812 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabra1P62812 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabra1P62812 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabra1P62812 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabra1P62812 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gabra1P62812 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gabra1P62812 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms