Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arf6P62331 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arf6P62331 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arf6P62331 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arf6P62331 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arf6P62331 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arf6P62331 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arf6P62331 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arf6P62331 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Arf6P62331 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arf6P62331 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arf6P62331 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arf6P62331 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arf6P62331 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arf6P62331 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Arf6P62331 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arf6P62331 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arf6P62331 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arf6P62331 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arf6P62331 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arf6P62331 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arf6P62331 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arf6P62331 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arf6P62331 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arf6P62331 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arf6P62331 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arf6P62331 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arf6P62331 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arf6P62331 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arf6P62331 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arf6P62331 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arf6P62331 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arf6P62331 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arf6P62331 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arf6P62331 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arf6P62331 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Arf6P62331 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arf6P62331 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arf6P62331 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arf6P62331 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Arf6P62331 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arf6P62331 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arf6P62331 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Arf6P62331 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arf6P62331 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arf6P62331 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arf6P62331 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arf6P62331 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arf6P62331 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arf6P62331 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arf6P62331 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arf6P62331 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arf6P62331 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arf6P62331 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arf6P62331 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arf6P62331 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arf6P62331 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arf6P62331 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arf6P62331 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arf6P62331 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arf6P62331 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arf6P62331 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arf6P62331 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arf6P62331 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arf6P62331 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arf6P62331 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arf6P62331 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arf6P62331 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arf6P62331 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arf6P62331 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Arf6P62331 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arf6P62331 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arf6P62331 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arf6P62331 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arf6P62331 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arf6P62331 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arf6P62331 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arf6P62331 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arf6P62331 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arf6P62331 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arf6P62331 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arf6P62331 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arf6P62331 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arf6P62331 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arf6P62331 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arf6P62331 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arf6P62331 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arf6P62331 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arf6P62331 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arf6P62331 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arf6P62331 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arf6P62331 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Arf6P62331 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arf6P62331 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arf6P62331 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arf6P62331 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arf6P62331 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arf6P62331 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arf6P62331 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Arf6P62331 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms