Protein–RNA interactions for Protein: P61588

Rnd3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnd3P61588 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnd3P61588 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnd3P61588 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnd3P61588 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnd3P61588 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnd3P61588 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnd3P61588 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnd3P61588 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnd3P61588 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnd3P61588 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnd3P61588 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnd3P61588 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnd3P61588 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnd3P61588 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnd3P61588 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnd3P61588 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnd3P61588 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnd3P61588 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnd3P61588 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnd3P61588 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnd3P61588 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnd3P61588 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnd3P61588 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnd3P61588 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnd3P61588 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnd3P61588 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnd3P61588 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnd3P61588 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnd3P61588 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnd3P61588 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnd3P61588 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnd3P61588 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnd3P61588 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnd3P61588 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnd3P61588 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnd3P61588 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnd3P61588 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnd3P61588 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnd3P61588 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnd3P61588 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnd3P61588 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnd3P61588 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnd3P61588 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnd3P61588 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnd3P61588 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnd3P61588 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnd3P61588 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnd3P61588 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnd3P61588 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rnd3P61588 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnd3P61588 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnd3P61588 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnd3P61588 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnd3P61588 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnd3P61588 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnd3P61588 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnd3P61588 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnd3P61588 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnd3P61588 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnd3P61588 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Rnd3P61588 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnd3P61588 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnd3P61588 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnd3P61588 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnd3P61588 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnd3P61588 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnd3P61588 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnd3P61588 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnd3P61588 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnd3P61588 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnd3P61588 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnd3P61588 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnd3P61588 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnd3P61588 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnd3P61588 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnd3P61588 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnd3P61588 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnd3P61588 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnd3P61588 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnd3P61588 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnd3P61588 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnd3P61588 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnd3P61588 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnd3P61588 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnd3P61588 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnd3P61588 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnd3P61588 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnd3P61588 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnd3P61588 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnd3P61588 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnd3P61588 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnd3P61588 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnd3P61588 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnd3P61588 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnd3P61588 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnd3P61588 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnd3P61588 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnd3P61588 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnd3P61588 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnd3P61588 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms