Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PlnP61014 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PlnP61014 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PlnP61014 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PlnP61014 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PlnP61014 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PlnP61014 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PlnP61014 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PlnP61014 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PlnP61014 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PlnP61014 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PlnP61014 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PlnP61014 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PlnP61014 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PlnP61014 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PlnP61014 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PlnP61014 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PlnP61014 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PlnP61014 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PlnP61014 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PlnP61014 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PlnP61014 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PlnP61014 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PlnP61014 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PlnP61014 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PlnP61014 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PlnP61014 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PlnP61014 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PlnP61014 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PlnP61014 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PlnP61014 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PlnP61014 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PlnP61014 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PlnP61014 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PlnP61014 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PlnP61014 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PlnP61014 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PlnP61014 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PlnP61014 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PlnP61014 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PlnP61014 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PlnP61014 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PlnP61014 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PlnP61014 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PlnP61014 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PlnP61014 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PlnP61014 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PlnP61014 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PlnP61014 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PlnP61014 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PlnP61014 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PlnP61014 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PlnP61014 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PlnP61014 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PlnP61014 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PlnP61014 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PlnP61014 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PlnP61014 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PlnP61014 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PlnP61014 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PlnP61014 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PlnP61014 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PlnP61014 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PlnP61014 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PlnP61014 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PlnP61014 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PlnP61014 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PlnP61014 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PlnP61014 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PlnP61014 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PlnP61014 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PlnP61014 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PlnP61014 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PlnP61014 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PlnP61014 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PlnP61014 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PlnP61014 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PlnP61014 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PlnP61014 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PlnP61014 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PlnP61014 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PlnP61014 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PlnP61014 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PlnP61014 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PlnP61014 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PlnP61014 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PlnP61014 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PlnP61014 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PlnP61014 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PlnP61014 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PlnP61014 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PlnP61014 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PlnP61014 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PlnP61014 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PlnP61014 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PlnP61014 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PlnP61014 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PlnP61014 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PlnP61014 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PlnP61014 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms