Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr2iP60898 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr2iP60898 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr2iP60898 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr2iP60898 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr2iP60898 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr2iP60898 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr2iP60898 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr2iP60898 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr2iP60898 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr2iP60898 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr2iP60898 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr2iP60898 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr2iP60898 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr2iP60898 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr2iP60898 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Polr2iP60898 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Polr2iP60898 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr2iP60898 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr2iP60898 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr2iP60898 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr2iP60898 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr2iP60898 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr2iP60898 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr2iP60898 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr2iP60898 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr2iP60898 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr2iP60898 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr2iP60898 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr2iP60898 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2iP60898 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2iP60898 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2iP60898 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2iP60898 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2iP60898 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2iP60898 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2iP60898 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2iP60898 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2iP60898 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2iP60898 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2iP60898 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2iP60898 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2iP60898 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2iP60898 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2iP60898 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2iP60898 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2iP60898 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2iP60898 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr2iP60898 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr2iP60898 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr2iP60898 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2iP60898 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2iP60898 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2iP60898 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2iP60898 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2iP60898 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr2iP60898 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr2iP60898 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2iP60898 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2iP60898 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2iP60898 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2iP60898 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2iP60898 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2iP60898 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2iP60898 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2iP60898 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2iP60898 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2iP60898 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2iP60898 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2iP60898 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2iP60898 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2iP60898 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr2iP60898 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr2iP60898 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr2iP60898 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr2iP60898 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr2iP60898 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr2iP60898 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr2iP60898 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr2iP60898 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr2iP60898 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr2iP60898 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr2iP60898 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr2iP60898 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2iP60898 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr2iP60898 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr2iP60898 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr2iP60898 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr2iP60898 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2iP60898 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2iP60898 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2iP60898 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2iP60898 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2iP60898 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2iP60898 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2iP60898 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2iP60898 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2iP60898 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2iP60898 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2iP60898 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms