Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ppfia3P60469 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ppfia3P60469 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ppfia3P60469 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ppfia3P60469 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ppfia3P60469 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ppfia3P60469 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ppfia3P60469 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ppfia3P60469 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppfia3P60469 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppfia3P60469 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppfia3P60469 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ppfia3P60469 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ppfia3P60469 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ppfia3P60469 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ppfia3P60469 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ppfia3P60469 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ppfia3P60469 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Ppfia3P60469 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ppfia3P60469 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ppfia3P60469 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ppfia3P60469 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ppfia3P60469 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ppfia3P60469 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ppfia3P60469 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ppfia3P60469 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ppfia3P60469 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ppfia3P60469 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ppfia3P60469 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppfia3P60469 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppfia3P60469 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppfia3P60469 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppfia3P60469 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ppfia3P60469 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ppfia3P60469 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ppfia3P60469 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ppfia3P60469 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppfia3P60469 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppfia3P60469 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ppfia3P60469 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ppfia3P60469 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ppfia3P60469 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ppfia3P60469 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ppfia3P60469 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Ppfia3P60469 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ppfia3P60469 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppfia3P60469 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppfia3P60469 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppfia3P60469 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppfia3P60469 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppfia3P60469 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ppfia3P60469 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ppfia3P60469 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ppfia3P60469 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppfia3P60469 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppfia3P60469 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppfia3P60469 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppfia3P60469 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppfia3P60469 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppfia3P60469 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppfia3P60469 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppfia3P60469 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppfia3P60469 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppfia3P60469 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ppfia3P60469 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ppfia3P60469 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppfia3P60469 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppfia3P60469 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppfia3P60469 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppfia3P60469 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppfia3P60469 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppfia3P60469 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppfia3P60469 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ppfia3P60469 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppfia3P60469 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppfia3P60469 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppfia3P60469 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppfia3P60469 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppfia3P60469 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ppfia3P60469 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ppfia3P60469 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ppfia3P60469 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppfia3P60469 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppfia3P60469 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppfia3P60469 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppfia3P60469 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppfia3P60469 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppfia3P60469 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppfia3P60469 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppfia3P60469 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppfia3P60469 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppfia3P60469 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppfia3P60469 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppfia3P60469 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppfia3P60469 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ppfia3P60469 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ppfia3P60469 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ppfia3P60469 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ppfia3P60469 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppfia3P60469 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms