Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
P58686 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
P58686 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
P58686 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
P58686 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
P58686 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
P58686 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
P58686 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
P58686 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
P58686 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
P58686 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
P58686 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
P58686 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
P58686 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
P58686 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
P58686 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
P58686 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
P58686 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
P58686 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
P58686 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
P58686 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
P58686 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
P58686 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
P58686 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
P58686 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
P58686 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
P58686 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
P58686 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
P58686 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
P58686 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
P58686 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
P58686 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
P58686 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
P58686 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
P58686 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
P58686 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
P58686 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
P58686 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
P58686 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
P58686 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
P58686 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
P58686 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
P58686 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
P58686 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
P58686 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
P58686 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
P58686 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
P58686 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
P58686 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
P58686 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
P58686 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
P58686 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
P58686 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
P58686 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
P58686 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
P58686 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
P58686 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
P58686 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
P58686 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
P58686 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
P58686 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
P58686 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
P58686 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
P58686 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
P58686 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
P58686 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
P58686 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
P58686 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
P58686 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
P58686 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
P58686 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
P58686 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
P58686 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
P58686 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
P58686 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P58686 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P58686 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P58686 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P58686 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
P58686 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P58686 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P58686 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
P58686 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P58686 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P58686 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P58686 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P58686 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P58686 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P58686 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
P58686 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
P58686 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
P58686 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
P58686 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
P58686 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P58686 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
P58686 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P58686 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P58686 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P58686 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
P58686 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms